RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 PAEPP09466 180 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 AMY2BP19961 511 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 C19orf57Q0VDD7 668 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 MFSD13AQ14CX5 517 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 NPY5RQ15761 445 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 CD226Q15762 336 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SEZ6Q53EL9 994 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SFT2D3Q587I9 215 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM205Q6UW68 189 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZRG5 221 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ANGPTL5Q86XS5 388 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ADGRG3Q86Y34 549 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ADGRF4Q8IZF3 695 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ADAMTS15Q8TE58 950 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC39A7Q92504 469 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 CAPNS2Q96L46 248 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 BMFQ96LC9 184 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 CGRRF1Q99675 332 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 TSSK6Q9BXA6 273 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM59Q9BXS4 323 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 C1orf198Q9H425 327 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 NGBQ9NPG2 151 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SAR1AQ9NR31 198 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 CDC14AQ9UNH5 594 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 PLLPQ9Y342 182 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 PRDM2Q13029 1718 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A1W2PQY0 241 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 DGKIO75912 1065 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 FABP3P05413 133 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 EBLN1P0CF75 366 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SFTPCP11686 197 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 CDK4P11802 303 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 GABRA5P31644 462 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 GPR12P47775 334 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 OR3A4PP47883 348 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 PCP4P48539 62 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 RBP2P50120 134 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 TCL1AP56279 114 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 WNT7BP56706 349 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 OR2B8PP59922 312 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 PPP1CAP62136 330 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 GUCA2BQ16661 112 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 HIST3H3Q16695 136 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SPIN4Q56A73 249 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 B3GNT9Q6UX72 402 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC26A9Q7LBE3 791 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ZSWIM9Q86XI8 627 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 DOLPP1Q86YN1 238 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 APCDD1Q8J025 514 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 KIAA1958Q8N8K9 716 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 STXBP6Q8NFX7 210 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 OR5B3Q8NH48 314 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ZFP90Q8TF47 636 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ST8SIA4Q92187 359 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 TAMM41Q96BW9 452 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 PPCDCQ96CD2 204 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 ZDHHC15Q96MV8 337 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 BARHL1Q9BZE3 327 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SEMA4AQ9H3S1 761 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 RDH14Q9HBH5 336 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 HES4Q9HCC6 221 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC39A2Q9NP94 309 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 NT5MQ9NPB1 228 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 TAS2R14Q9NYV8 317 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC17A7Q9P2U7 560 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 HEY1Q9Y5J3 304 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 RNF215Q9Y6U7 377 aa3□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 LAMC1P11047 1609 aa2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 UTYO14607 1347 aa2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 RPTORQ8N122 1335 aa2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A0U1RQJ8 604 aa2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 LNP1A1A4G5 178 aa2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 NKX6-3A6NJ46 265 aa2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 C12orf71A8MTZ7 269 aa2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 SP9P0CG40 484 aa2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 RBMY1CP0DJD4 496 aa2.99□□□□□ -1.93
JMJD1C-210ENST00000542921 G6PDP11413 515 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms