RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 CRHP06850 196 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 NGFRP08138 427 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 BCKDHAP12694 445 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 CD99P14209 185 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 ADAM8P78325 824 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 OCRLQ01968 901 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 C17orf67Q0P5P2 114 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 HSPB3Q12988 150 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 GANABQ14697 944 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 MLC1Q15049 377 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 DUSP5Q16690 384 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 GALNT10Q86SR1 603 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 UBQLNLQ8IYU4 475 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 METTL25Q8N6Q8 603 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC63Q8NA47 563 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 NUP43Q8NFH3 380 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 CLHC1Q8NHS4 586 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 MARK4Q96L34 752 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 C3orf30Q96M34 536 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 MECRQ9BV79 373 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 SH3BP4Q9P0V3 963 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 GIMAP2Q9UG22 337 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP6V1HQ9UI12 483 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 PACSIN3Q9UKS6 424 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAF6Q9Y4K3 522 aa10.63□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 SH3D21A4FU49 640 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC01387J3KSC0 135 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 PDPK1O15530 556 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 EMC8O43402 210 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 NPHS1O60500 1241 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 AQP8O94778 261 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNK2O95069 426 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 GOSR1O95249 250 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 NUDT17P0C025 328 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 CD53P19397 219 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 KLK2P20151 261 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 TBXA2RP21731 343 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 DNASE1P24855 282 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 LOXP28300 417 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC6A8P48029 635 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 PRKAG1P54619 331 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 DIO3P55073 304 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 MANFP55145 182 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 XKR7Q5GH72 579 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 RAET1LQ5VY80 246 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 MFSD12Q6NUT3 480 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 CDRT4Q8N9R6 151 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 CEP70Q8NHQ1 597 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 FNDC9Q8TBE3 224 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 GPR151Q8TDV0 419 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 TWIST2Q8WVJ9 160 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF524Q96C55 264 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 PPCDCQ96CD2 204 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 APOPT1Q96IL0 206 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 ADGRG7Q96K78 797 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM111AQ96PZ2 611 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 ALPK1Q96QP1 1244 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 ACBD3Q9H3P7 528 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 EQTNQ9NQ60 294 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 LGALS13Q9UHV8 139 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 FIS1Q9Y3D6 152 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 TESMINQ9Y4I5 508 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 AP4B1Q9Y6B7 739 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 PRR14LQ5THK1 2151 aa10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.62□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 TLDC2A0PJX2 215 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 DEFB108AA8MXU0 73 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 H3BML4 177 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 PIP5K1BO14986 540 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 CTIFO43310 598 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 EFNA2O43921 213 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 SPAG7O75391 227 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNH1O95259 989 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 RAF1P04049 648 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 CD8BP10966 210 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 LAMP1P11279 417 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 NID1P14543 1247 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 HOXC12P31275 282 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 CCKARP32238 428 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 ETV4P43268 484 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 RFX3P48380 749 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 VSNL1P62760 191 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL38P63173 70 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 POU4F3Q15319 338 aa10.61□□□□□ -0.71
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms