RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508242.1

MRPS35P2-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S35 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene MRPS35P2, Length 191 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P2-201ENST00000508242 FZR1Q9UM11 496 aa0.76□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 WDR45Q9Y484 360 aa0.76□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 RFNGQ9Y644 331 aa0.76□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.76□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 PCM1Q15154 2024 aa0.76□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 COLCA2A8K830 154 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 SLC16A8O95907 504 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 PCCBP05166 539 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 PGK2P07205 417 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 APRTP07741 180 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 SFTPBP07988 381 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 CCNA2P20248 432 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 HNF1AP20823 631 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 ADORA2BP29275 332 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 RAD52P43351 418 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 KIR2DS2P43631 304 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 ACTA2P62736 377 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 ACTC1P68032 377 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 NOP14P78316 857 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 NPRL3Q12980 569 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 ARFRP1Q13795 201 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 DEFB116Q30KQ4 102 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 TEX44Q53QW1 395 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZNF789Q5FWF6 425 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 OLFM4Q6UX06 510 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 LCA5Q86VQ0 697 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 METTL23Q86XA0 190 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 SKA3Q8IX90 412 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 UBALD1Q8TB05 177 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 OR1E3Q8WZA6 343 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 AP2M1Q96CW1 435 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 ACCSQ96QU6 501 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 ACPTQ9BZG2 426 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 FANCFQ9NPI8 374 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 BTNL2Q9UIR0 455 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZNF229Q9UJW7 825 aa0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 PTPRUQ92729 1446 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 TRAV34A0A0B4J273 112 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 SDC3O75056 442 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 SCRG1O75711 98 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 SNAPINO95295 136 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 SLC4A1P02730 911 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 RNH1P13489 461 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 UQCRC2P22695 453 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 HOXA9P31269 272 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 GCKP35557 465 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 GPC3P51654 580 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 RPS6P62753 249 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 PRSS8Q16651 343 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 FAM83EQ2M2I3 478 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZNF311Q5JNZ3 666 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 PAGE3Q5JUK9 113 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 PET117Q6UWS5 81 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 NEGR1Q7Z3B1 354 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 LINC00304Q8N9R0 145 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZNF740Q8NDX6 193 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 OR4F17Q8NGA8 305 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 OR10G2Q8NGC3 310 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 HIST1H2ACQ93077 130 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 CEP170P1Q96L14 293 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 PANX3Q96QZ0 392 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 OR2M2Q96R28 347 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 OR4F4Q96R69 305 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 NRIP2Q9BQI9 281 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 GPR61Q9BZJ8 451 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 ANKEF1Q9NU02 776 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 CDH7Q9ULB5 785 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 ENTPD4Q9Y227 616 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 TTLL3Q9Y4R7 772 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 DOCK9Q9BZ29 2069 aa0.74□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 BUB1O43683 1085 aa0.73□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 RCBTB2O95199 551 aa0.73□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 CISD3P0C7P0 127 aa0.73□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 KCNJ1P48048 391 aa0.73□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 EMDP50402 254 aa0.73□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 RAG2P55895 527 aa0.73□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 HERV-K104P63124 156 aa0.73□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 TFCP2Q12800 502 aa0.73□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
MRPS35P2-201ENST00000508242 CCDC57Q2TAC2 916 aa0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms