RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511		H0YC42	278 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GUCY1B2	O75343	617 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CGA	P01215	116 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK1	P06870	262 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	THBD	P07204	575 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GFAP	P14136	432 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIC	P45877	212 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB10	P61026	200 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FAP	Q12884	760 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXW5	Q969U6	566 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINI1	Q99574	410 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	NTMT1	Q9BV86	223 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	BEX2	Q9BXY8	128 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF122	Q9H9V4	155 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	AHSP	Q9NZD4	102 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PSME2	Q9UL46	239 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	LIPT1	Q9Y234	373 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF175	Q9Y473	711 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PP18	115 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SYCE1L	A8MT33	242 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511		H0YIV9	168 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SCO2	O43819	266 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ZIC3	O60481	467 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	KERA	O60938	352 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN15	O95858	294 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	S1PR1	P21453	382 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	DRD5	P21918	477 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3CG	P48736	1102 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH9A1	P49189	494 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK12	P53778	367 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN15	P56746	228 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GPX6	P59796	221 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP4K2	Q12851	820 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	STX5	Q13190	355 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	STK32C	Q86UX6	486 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL29	Q96CT2	875 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	DSN1	Q9H410	356 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MED12L	Q86YW9	2145 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf226	A1L170	272 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	T	O15178	435 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	DLX3	O60479	287 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA3D	O95025	777 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCA1	O95477	2261 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ESRRB	O95718	433 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP1B1	P05026	303 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FES	P07332	822 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CD3E	P07766	207 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GP5	P40197	560 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	LTB4R	Q15722	352 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PFKFB4	Q16877	469 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ISCA2	Q86U28	154 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		9.69	□□□□□ -0.86

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