RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	HAS3	O00219	553 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	RFXANK	O14593	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	FPGT	O14772	594 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	RGS5	O15539	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	FFAR2	O15552	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	MPZL2	O60487	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	TMCC2	O75069	709 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	DIRAS1	O95057	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	PTH	P01270	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	C1QB	P02746	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	PIRT	P0C851	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	UBL4A	P11441	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	BCKDHA	P12694	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	GABRB1	P18505	474 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	PRKACB	P22694	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	MYL9	P24844	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	EPHA2	P29317	976 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	PTPN6	P29350	595 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	CDKN2C	P42773	168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	PTGER3	P43115	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	HSPA7	P48741	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	RGS4	P49798	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	RORC	P51449	518 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	RAB25	P57735	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	HMGCS1	Q01581	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	ST3GAL4	Q11206	333 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	SLAMF1	Q13291	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	TNK1	Q13470	666 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	VEZF1	Q14119	521 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	VGLL4	Q14135	290 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	QPRT	Q15274	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983		Q5BKY6	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	SBSN	Q6UWP8	590 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	CADM2	Q8N3J6	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	ELMO1	Q92556	727 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	TESC	Q96BS2	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	EGFL8	Q99944	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	NTMT1	Q9BV86	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	BBS2	Q9BXC9	721 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	RNF121	Q9H920	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	C12orf10	Q9HB07	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB4-208	ENST00000467983	CLN6	Q9NWW5	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms