RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SLC35B4	Q969S0	331 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SDF2	Q99470	211 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	COQ7	Q99807	217 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	DAPP1	Q9UN19	280 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CDH23	Q9H251	3354 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PQF6	199 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	DNAJB6	O75190	326 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	HMGN1	P05114	100 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CSF3	P09919	207 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFV2	P19404	249 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	COL9A1	P20849	921 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	HOXD12	P35452	270 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	NFATC4	Q14934	902 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TCEA2	Q15560	299 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	DEFB134	Q4QY38	66 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	EIPR1	Q53HC9	387 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	FHL5	Q5TD97	284 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	OR2T33	Q8NG76	320 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	OR52N1	Q8NH53	320 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		15.78	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SLC2A10	O95528	541 aa		15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CPM	P14384	443 aa		15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	RAB43	Q86YS6	212 aa		15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PIGU	Q9H490	435 aa		15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	FBRS	Q9HAH7	460 aa		15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		15.77	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058		A6NCN8	305 aa		15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058		J3QRE1	110 aa		15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	CHST10	O43529	356 aa		15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	B3GALT2	O43825	422 aa		15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	NR4A2	P43354	598 aa		15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	FCRL6	Q6DN72	434 aa		15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	SAMD8	Q96LT4	415 aa		15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	UBQLN3	Q9H347	655 aa		15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		15.77	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	SMIM30	A4D0T7	59 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TMCC2	O75069	709 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	GSTT2	P0CG29	244 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	GSTT2B	P0CG30	244 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	UGT2B7	P16662	529 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	FZD5	Q13467	585 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TAB1	Q15750	504 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	WDR92	Q96MX6	357 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	SLC22A4	Q9H015	551 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	NEK6	Q9HC98	313 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	URAD	A6NGE7	173 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058		H0Y8X5	98 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	RFXAP	O00287	272 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	LAMP2	P13473	410 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	GCGR	P47871	477 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PPP3R1	P63098	170 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	MAPK14	Q16539	360 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	VASN	Q6EMK4	673 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	SDE2	Q6IQ49	451 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		15.76	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11

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