RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 MMP11P24347 488 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A6P31641 620 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 GSK3BP49841 420 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SULT1A2P50226 295 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 CKS1BP61024 79 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 MC1RQ01726 317 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 HEPACAMQ14CZ8 416 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM71Q6P5X7 295 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SV2AQ7L0J3 742 aa5.3□□□□□ -1.56
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PTPRC-209ENST00000442510 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 OR13G1Q8NGZ3 307 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa5.3□□□□□ -1.56
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PTPRC-209ENST00000442510 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.3□□□□□ -1.56
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PTPRC-209ENST00000442510 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.3□□□□□ -1.56
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PTPRC-209ENST00000442510 AMHR2Q16671 573 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 MIIPQ5JXC2 388 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF286BP0CG31 522 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-209ENST00000442510 GRHL3Q8TE85 626 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF426Q9BUY5 554 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 TKTL2Q9H0I9 626 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 IL21RQ9HBE5 538 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-209ENST00000442510 CXCR6O00574 342 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF697Q5TEC3 545 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 OR2G6Q5TZ20 316 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZN92 141 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 OR6N2Q8NGY6 317 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 OR51Q1Q8NH59 317 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SFRP2Q96HF1 295 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 SENP8Q96LD8 212 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 GPR137Q96N19 417 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-209ENST00000442510 PITX2Q99697 317 aa5.29□□□□□ -1.56
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