RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM53BQ14153 422 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HERC3Q15034 1050 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TGFBIQ15582 683 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDK4Q16654 411 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 XKR6Q5GH73 641 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF766Q5HY98 468 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATG9BQ674R7 924 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATG16L1Q676U5 607 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGFL3Q6UXB1 125 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GFRALQ6UXV0 394 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPSM1Q86YR5 675 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HPS6Q86YV9 775 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CA13Q8N1Q1 262 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 BBOF1Q8ND07 529 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMF1Q92530 271 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HTRA1Q92743 480 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DPF1Q92782 380 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHBDF1Q96CC6 855 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TM4SF19Q96DZ7 209 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAAR6Q96RI8 345 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LPAR4Q99677 370 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPAS2Q99743 824 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPNE1Q99829 537 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUBB6Q9BUF5 446 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DERL2Q9GZP9 239 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PELI2Q9HAT8 420 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJC11Q9NVH1 559 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 COX11Q9Y6N1 276 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLQO75417 2590 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 APCP25054 2843 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED12LQ86YW9 2145 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TACC2O95359 2948 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS13CQ709C8 3753 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKAP6Q13023 2319 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAV17A0A0B4J275 112 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0G2JMM0 328 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PPB8 328 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PRS3 328 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC22A23A1A5C7 686 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKDD1BA6NHY2 528 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAGE2PA6NJ88 616 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIR3DP1A8MWS1 328 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEB17A8MXT2 336 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCIDASD6RGH6 385 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 G3V3Y1 287 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRTM2O43300 516 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL41O60662 606 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LDB3O75112 727 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 STK16O75716 305 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 WISP2O76076 250 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRATO95237 230 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CBX6O95503 412 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLAUP00749 431 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LDLRP01130 860 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1QAP02745 245 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNH1P13489 461 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GFAPP14136 432 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HRH2P25021 359 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSH2P43246 934 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SSR2P43308 183 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEA4P43358 317 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINB8P50452 374 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TDGF1P3P51864 188 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAP1GDS1P52306 607 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MVDP53602 400 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC26A5P58743 744 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SKP1P63208 163 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTN3A2P78410 334 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHIT1Q13231 466 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DOC2AQ14183 400 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR1C1Q15619 314 aa4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXT1Q16394 746 aa4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms