RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TBK1Q9UHD2 729 aa8.5□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DNHD1Q96M86 4753 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A0A1W2PPM1 405 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SH3D21A4FU49 640 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC22A20A6NK97 555 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NPIPB8E9PQR5 432 aa8.49□□□□□ -1.05
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 IL33O95760 270 aa8.49□□□□□ -1.05
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 DNAJB13P59910 316 aa8.49□□□□□ -1.05
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 IMPG1Q17R60 797 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.49□□□□□ -1.05
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 NOXRED1Q6NXP6 359 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 STARD4Q96DR4 205 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ELP4Q96EB1 424 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.49□□□□□ -1.05
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DSN1Q9H410 356 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q9N2J8 555 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR2M5A3KFT3 312 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H0YC42 278 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC01387J3KSC0 135 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TNFRSF21O75509 655 aa8.48□□□□□ -1.05
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 UROSP10746 265 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PEPDP12955 493 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FOSL1P15407 271 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HK1P19367 917 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CD53P19397 219 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HOXC12P31275 282 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCKARP32238 428 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CRHR1P34998 444 aa8.48□□□□□ -1.05
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 STX5Q13190 355 aa8.48□□□□□ -1.05
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCDC153Q494R4 210 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAET1LQ5VY80 246 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VWA1Q6PCB0 445 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TDRPQ86YL5 185 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBQLNLQ8IYU4 475 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KIF18AQ8NI77 898 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NUDT8Q8WV74 236 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FIG4Q92562 907 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EGLN2Q96KS0 407 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FCRL1Q96LA6 429 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RNF122Q9H9V4 155 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OXSMQ9NWU1 459 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MED11Q9P086 117 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF175Q9Y473 711 aa8.48□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.47□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TTC36A6NLP5 189 aa8.47□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EMC8O43402 210 aa8.47□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TBX19O60806 448 aa8.47□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CRCPO75575 148 aa8.47□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SASH3O75995 380 aa8.47□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UTS2O95399 124 aa8.47□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CGAP01215 116 aa8.47□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGKV1D-16P01601 117 aa8.47□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NID1P14543 1247 aa8.47□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FRKP42685 505 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCT5P48643 541 aa8.47□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CLDN20P56880 219 aa8.47□□□□□ -1.05
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