RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 CD180Q99467 661 aa21.54■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 ERVK-19Q9WJR5 959 aa21.54■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 C12orf73Q69YU5 71 aa21.53■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 CD300LDQ6UXZ3 194 aa21.53■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 MPZL2O60487 215 aa21.52■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 NIPAL1Q6NVV3 410 aa21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 PLXDC1Q8IUK5 500 aa21.52■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 CDHR4A6H8M9 788 aa21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 CTF1Q16619 201 aa21.52■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 RNF217Q8TC41 542 aa21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 VSTM2LQ96N03 204 aa21.52■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 FOLR1P15328 257 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 STT3AP46977 705 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 PLAURQ03405 335 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 PDZK1Q5T2W1 519 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 OR1L3Q8NH93 324 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 NR4A3Q92570 626 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 NUDT22Q9BRQ3 303 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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FAAP20-209ENST00000428120 H3BMH7 237 aa21.51■■□□□ 1.03
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FAAP20-209ENST00000428120 OR5F1O95221 314 aa21.51■■□□□ 1.03
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FAAP20-209ENST00000428120 IFI6P09912 130 aa21.51■■□□□ 1.03
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FAAP20-209ENST00000428120 OMPP47874 163 aa21.51■■□□□ 1.03
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FAAP20-209ENST00000428120 NPSR1Q6W5P4 371 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 PIGXQ8TBF5 258 aa21.51■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 YIPF6Q96EC8 236 aa21.51■■□□□ 1.03
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FAAP20-209ENST00000428120 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CDK4P11802 303 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 IFNGR2P38484 337 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 HSD17B7P56937 341 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CLIP3Q96DZ5 547 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 SH3D21A4FU49 640 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 GSTM3P21266 225 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 DECR1Q16698 335 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 UBE2UQ5VVX9 321 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 OR8D4Q8NGM9 314 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 C16orf52Q8NHV5 167 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC74AQ96AQ1 378 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 PTCHD1Q96NR3 888 aa21.5■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD19PQ9H560 264 aa21.5■■□□□ 1.03
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FAAP20-209ENST00000428120 ZNF749O43361 778 aa21.49■■□□□ 1.03
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FAAP20-209ENST00000428120 TSPAN31Q12999 210 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 MINDY4Q4G0A6 757 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 P2RY8Q86VZ1 359 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 RCBTB1Q8NDN9 531 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 OR8J1Q8NGP2 316 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 OR10A5Q9H207 317 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 IL20RAQ9UHF4 553 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 PRAMEF2O60811 474 aa21.49■■□□□ 1.03
FAAP20-209ENST00000428120 OR1Q1Q15612 314 aa21.49■■□□□ 1.03
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