RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410983.1

RNU6-564P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 564, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-564P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-564P-201ENST00000410983 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-564P-201ENST00000410983 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-564P-201ENST00000410983 LRRC40Q9H9A6 602 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-564P-201ENST00000410983 ELOVL2Q9NXB9 296 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-564P-201ENST00000410983 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-564P-201ENST00000410983 ANAPC7Q9UJX3 599 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-564P-201ENST00000410983 NTNG1Q9Y2I2 539 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-564P-201ENST00000410983 WDR45Q9Y484 360 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-564P-201ENST00000410983 RPL4P36578 427 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 PLA2G16P53816 162 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 BDH1Q02338 343 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 RGS1Q08116 209 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 CRMP1Q14194 572 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 SYPL1Q16563 259 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 C14orf177Q52M58 125 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 LGSNQ5TDP6 509 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ATF7IP2Q5U623 682 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 STAC2Q6ZMT1 411 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF497Q6ZNH5 498 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ANKFN1Q8N957 763 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 PSMB7Q99436 277 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 VGLL1Q99990 258 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 TRIM15Q9C019 465 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 VCX2Q9H322 139 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 GNG12Q9UBI6 72 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 HPCAL4Q9UM19 191 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 RABL2BQ9UNT1 228 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 CACNA1FO60840 1977 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 GON4LQ3T8J9 2241 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 SERPINB2P05120 415 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 HBQ1P09105 142 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 IGFBP5P24593 272 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 PTGER3P43115 390 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 CSRP3P50461 194 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 UBE2HP62256 183 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 IL18R1Q13478 541 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 NHLRC3Q5JS37 347 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 MEDAGQ5VYS4 303 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 OR8G2PQ6IF36 304 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 PMF1Q6P1K2 205 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 PAQR6Q6TCH4 344 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 KIAA1328Q86T90 577 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ACOT1Q86TX2 421 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 IFNEQ86WN2 208 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF440Q8IYI8 595 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 BPIFB2Q8N4F0 458 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 M1APQ8TC57 530 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 RIT2Q99578 217 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 PRODH2Q9UF12 536 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 PRSS21Q9Y6M0 314 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 USP6P35125 1406 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 SHISA9B4DS77 424 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 SNNO75324 88 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 RENP00797 406 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 PGCP20142 388 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 TPSB2P20231 275 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 TBXA2RP21731 343 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 MT3P25713 68 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 HMGCLP35914 325 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 GNPDA1P46926 289 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ARHGDIBP52566 201 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 TPSAB1Q15661 275 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 MICAQ29983 383 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 TMEM225Q6GV28 225 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF679Q8IYX0 411 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 LRRC43Q8N309 656 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 SYT14Q8NB59 555 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 PSKH2Q96QS6 385 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZBP1Q9H171 429 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 GNB4Q9HAV0 340 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 TIGARQ9NQ88 270 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-564P-201ENST00000410983 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms