RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409148.1

LRRTM1-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,126 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-202ENST00000409148 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 BLACEA4D250 179 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 CT62P0C5K7 136 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 RNH1P13489 461 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 NID1P14543 1247 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 FPR3P25089 353 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 MAP3K8P41279 467 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 STAT5AP42229 794 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 SNAPC1Q16533 368 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 ACSM5Q6NUN0 579 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 NKAIN4Q8IVV8 208 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 SHISA5Q8N114 240 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 VWA5B2Q8N398 1253 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 SLC38A2Q96QD8 506 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 EGLN3Q9H6Z9 239 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 CNIH4Q9P003 139 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM1-202ENST00000409148 SNTNA6NMZ2 147 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FZD5Q13467 585 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SYT14P1Q58G82 188 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 RNLSQ5VYX0 342 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MRGPREQ86SM8 312 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 KBTBD8Q8NFY9 601 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 OR5M11Q96RB7 305 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MAP3K3Q99759 626 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NTNG1Q9Y2I2 539 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 I3L1I5 382 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CTSBP07858 339 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ADRA2AP08913 450 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 GABRA3P34903 492 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF136P52737 540 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MAP4K2Q12851 820 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 GALNT12Q8IXK2 581 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM163Q8TC26 289 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 OSTF1Q92882 214 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 LRR1Q96L50 414 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MND1Q9BWT6 205 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TEX12Q9BXU0 123 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FBXO8Q9NRD0 319 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NLGN3Q9NZ94 848 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SLC7A7Q9UM01 511 aa16.01■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 HYKKA2RU49 373 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CCRL2O00421 344 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NKX2-2O95096 273 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 THY1P04216 161 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 EFNB1P98172 346 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SLC13A2Q13183 592 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 INAQ16352 499 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MAPK14Q16539 360 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TSTQ16762 297 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SLC36A4Q6YBV0 504 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 BTLAQ7Z6A9 289 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SLC34A3Q8N130 599 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 OR52R1Q8NGF1 315 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 HPS1Q92902 700 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 DSN1Q9H410 356 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 EVA1AQ9H8M9 152 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 AKIP1Q9NQ31 210 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 SACM1LQ9NTJ5 587 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 HCN3Q9P1Z3 774 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 IRGMA1A4Y4 181 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 BRINP1O60477 761 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 CBX7O95931 251 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MAOBP27338 520 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TGFBR1P36897 503 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 STX4Q12846 297 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 KLHL22Q53GT1 634 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 FIGNL1Q6PIW4 674 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 NRMQ8IXM6 262 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF595Q8IYB9 648 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 OR8D4Q8NGM9 314 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM255BQ8WV15 326 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-202ENST00000409148 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.8 ms