RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF525Q8N782 197 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 OR7G2Q8NG99 324 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ERP27Q96DN0 273 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 MTBPQ96DY7 904 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 FAIM2Q9BWQ8 316 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 TNFSF11O14788 317 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ADAP00813 363 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 DR1Q01658 176 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 AGAP6Q5VW22 663 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf71Q6IPW1 123 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 APOOLQ6UXV4 268 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35F6Q8N357 371 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CEP112Q8N8E3 955 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 OR2V1Q8NHB1 315 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CHODLQ9H9P2 273 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 FAIMQ9NVQ4 179 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 TAS2R9Q9NYW1 312 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 STOML1Q9UBI4 398 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 FREM1Q5H8C1 2179 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0J9YW62 118 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMDEC1O15204 470 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 DLX3O60479 287 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ESRRBO95718 433 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 PDYNP01213 254 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CDH11P55287 796 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 C17orf67Q0P5P2 114 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 TRAF3Q13114 568 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 FAM120AOSQ5T036 256 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 EXOC3L1Q86VI1 746 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 PPM1NQ8N819 430 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 SNX12Q9UMY4 172 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 SNX24Q9Y343 169 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 PLOD3O60568 738 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ANGPTL1O95841 491 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 PGRP06401 933 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 C2P06681 752 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF17P17021 662 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CLK3P49761 638 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ACAP2Q15057 778 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CYP27C1Q4G0S4 372 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM201Q5SNT2 666 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 LIPNQ5VXI9 398 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 HBMQ6B0K9 141 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CYS1Q717R9 158 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC25Q86WR0 208 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 TUSC5Q8IXB3 177 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 BANPQ8N9N5 519 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 OR4F6Q8NGB9 312 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 C10orf105Q8TEF2 133 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ABHD3Q8WU67 409 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 FAM168AQ92567 244 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 POTEKPQ9BYX7 375 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ELOVL6Q9H5J4 265 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM185BQ9H7F4 350 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 KCNAB3O43448 404 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 IL3P08700 152 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 PYGBP11216 843 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 RFX3P48380 749 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 RAC1P63000 192 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 P2RY6Q15077 328 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 RAB35Q15286 201 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 FAM83EQ2M2I3 478 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 SLC9A6Q92581 669 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 OSTF1Q92882 214 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 PHF21BQ96EK2 531 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 GPR78Q96P69 363 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 KCNS2Q9ULS6 477 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF814B7Z6K7 855 aa17.08■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 E7EQL1 145 aa17.08■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 ABCD4O14678 606 aa17.08■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 IL33O95760 270 aa17.08■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 USF1P22415 310 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 TTKP33981 857 aa17.08■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 ITGADQ13349 1161 aa17.08■□□□□ 0.32
HOXD12-201ENST00000404162 DECR1Q16698 335 aa17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms