RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CD200R1Q8TD46 325 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLAMF9Q96A28 289 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 Q9N2J8 555 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 C5AR2Q9P296 337 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 A0A0B4J2A0 478 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CIB4A0PJX0 185 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 HYKKA2RU49 373 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 GGT3PA6NGU5 568 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 FAM183AA6NL82 134 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 RNF13O43567 381 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 TSPAN6O43657 245 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PPP1R3DO95685 299 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 BPNT1O95861 308 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ADRB1P08588 477 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 GABRA5P31644 462 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 HNF1BP35680 557 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 MAP2K5Q13163 448 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 P2RY14Q15391 338 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 COMMD6Q7Z4G1 85 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLC9B2Q86UD5 537 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SMPDL3BQ92485 455 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SCAMP4Q969E2 229 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 MOAP1Q96BY2 351 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 EGLN2Q96KS0 407 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CDC6Q99741 560 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 DPH1Q9BZG8 443 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CLMPQ9H6B4 373 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 LIPT1Q9Y234 373 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 FAM171A2A8MVW0 826 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SCDO00767 359 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 GAAP10253 952 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ACP2P11117 423 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SERPINF1P36955 418 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 GZMKP49863 264 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 AKR1C2P52895 323 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 AKR1C1Q04828 323 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PDZK1IP1Q13113 114 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PDSS1Q5T2R2 415 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZVL8 140 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 GPR135Q8IZ08 494 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PELI3Q8N2H9 469 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 OR13C3Q8NGS6 347 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 DOK4Q8TEW6 326 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 MALSU1Q96EH3 234 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SEC22AQ96IW7 307 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 C4orf36Q96KX1 117 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ACPTQ9BZG2 426 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 BABAM2Q9NXR7 383 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PIRO00625 290 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 NPC1O15118 1278 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 EMC8O43402 210 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 RAD1O60671 282 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CSO75390 466 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ADH1AP07327 375 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 JUNDP17535 347 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 AHRP35869 848 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 RAB4BP61018 213 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 TBPL1P62380 186 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLC35A2P78381 396 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PDGFRLQ15198 375 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CD276Q5ZPR3 534 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLC51BQ86UW2 128 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 OR5H2Q8NGV7 314 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 OR2T11Q8NH01 316 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 C14orf79Q96F83 325 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SEC22CQ9BRL7 303 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 TSPAN11A1L157 253 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ZNF726A6NNF4 738 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 B4DXG7 233 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 K7EPK0 472 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 TO15178 435 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ADAM12O43184 909 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 TNFSF12O43508 249 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 KCNE1P15382 129 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CAV2P51636 162 aa9.26□□□□□ -0.93
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