RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395740.5

FGD4-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FGD4, Length 2,691 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4-201ENST00000395740 GPR34Q9UPC5 381 aa4.76□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 BAIAP2Q9UQB8 552 aa4.76□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 A0A1B0GW55 424 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 K7ERQ8 282 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 GPR171O14626 319 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 REM1O75628 298 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 GATBO75879 557 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 SOX14O95416 240 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 AGR2O95994 175 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 KLK1P06870 262 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 DUX4L2P0CJ85 424 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 DUX4L3P0CJ86 424 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 DUX4L4P0CJ87 422 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 DUX4L5P0CJ88 424 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 DUX4L6P0CJ89 424 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 DUX4L7P0CJ90 424 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 ACP5P13686 325 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 FEN1P39748 380 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 OPRD1P41143 372 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 TSFMP43897 325 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 CCT3P49368 545 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 CTBP2P56545 445 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 SCAND1P57086 179 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 AP3S2P59780 193 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 RAP2BP61225 183 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 POU4F2Q12837 409 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 FZD5Q13467 585 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 CEBPEQ15744 281 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 PRSS53Q2L4Q9 553 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 PGGHGQ32M88 737 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 CLVS2Q5SYC1 327 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 ADNP2Q6IQ32 1131 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 DEF8Q6ZN54 512 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 KRT74Q7RTS7 529 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 OVCH1Q7RTY7 1134 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 NPAS4Q8IUM7 802 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 OR8H3Q8N146 312 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 TOMM5Q8N4H5 51 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 ACBD7Q8N6N7 88 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 GPR156Q8NFN8 814 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 OR2T4Q8NH00 348 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 C1orf216Q8TAB5 229 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 DIO2Q92813 273 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 YIPF5Q969M3 257 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 WBP2Q969T9 261 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 MED8Q96G25 268 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 DNTTIP1Q9H147 329 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 SLC6A15Q9H2J7 730 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 LDAHQ9H6V9 325 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 MBD2Q9UBB5 411 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 RHCGQ9UBD6 479 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 DUX4Q9UBX2 424 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 POMT2Q9UKY4 750 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 ACSL5Q9ULC5 683 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 A0A087WUU8 490 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 A0A0G2JK05 382 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 LRRN3E7EW58 273 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 FZD7O75084 574 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 AQP8O94778 261 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 OR2A4O95047 310 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 OR12D1P0DN82 309 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 ALPPL2P10696 532 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 KELP23276 732 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 LCN1P31025 176 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 TRIM23P36406 574 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 ARPP19P56211 112 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 ACTC1P68032 377 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 ACTA1P68133 377 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 REEP5Q00765 189 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 MC1RQ01726 317 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 NOGQ13253 232 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 RAB33AQ14088 237 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 TMEM35AQ53FP2 167 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 OLFML2AQ68BL7 652 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 SLC30A6Q6NXT4 461 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 SFXN4Q6P4A7 337 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 TFAP2EQ6VUC0 442 aa4.75□□□□□ -1.65
FGD4-201ENST00000395740 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa4.75□□□□□ -1.65
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