RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 SLC28A2O43868 658 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 WDPCPO95876 746 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 KDELR2P33947 212 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 FBXW4P57775 412 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ZAR1Q86SH2 424 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 OR5M3Q8NGP4 307 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 G6PC3Q9BUM1 346 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 PLA2G3Q9NZ20 509 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 HLCSP50747 726 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ST3GAL2Q16842 350 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 DESI1Q6ICB0 168 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 METTL25Q8N6Q8 603 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 NFKBIDQ8NI38 313 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM19Q96HH6 336 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 COL21A1Q96P44 957 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 HPF1Q9NWY4 346 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 OR6C70A6NIJ9 312 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 FCMRO60667 390 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 UGT2B11O75310 529 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 STX11O75558 287 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 H6PDO95479 791 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CHRM4P08173 479 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ATP6V1C1P21283 382 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CYB561P49447 251 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 PNLIPRP2P54317 469 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 HPCAP84074 193 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CDK6Q00534 326 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 TUBA3CQ13748 450 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 SCARB2Q14108 478 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 TBCELQ5QJ74 424 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 TUBA3EQ6PEY2 450 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC80Q76M96 950 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF350Q9GZX5 532 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 MAGIXQ9H6Y5 334 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 RUBCNLQ9H714 662 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 RIMS3Q9UJD0 308 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 RPS6KA6Q9UK32 745 aa27.18■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 FCGR1AP12314 374 aa27.17■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CD96P40200 585 aa27.17■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CASRP41180 1078 aa27.17■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 SESN3P58005 492 aa27.17■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 NTRK2Q16620 822 aa27.17■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 COL28A1Q2UY09 1125 aa27.17■■□□□ 1.94
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ECHS1-201ENST00000368547 IGFL2Q6UWQ7 119 aa27.17■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 RNF145Q96MT1 663 aa27.17■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 AURKCQ9UQB9 309 aa27.17■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ANGPT4Q9Y264 503 aa27.17■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 C5orf58C9J3I9 102 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ABCB7O75027 752 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINA1P01009 418 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CRISP3P54108 245 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 GNA13Q14344 377 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00303Q3SY05 128 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 RNF32Q9H0A6 362 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 MKLN1Q9UL63 735 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 WDR45Q9Y484 360 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ATMQ13315 3056 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 RAP2AP10114 183 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CYP4B1P13584 511 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CHRNEQ04844 493 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 FRRS1Q6ZNA5 592 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 NUP54Q7Z3B4 507 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 OR10G3Q8NGC4 313 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ABHD17AQ96GS6 310 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 SLC38A1Q9H2H9 487 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 YY1AP1Q9H869 796 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 LRFN1Q9P244 771 aa27.16■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 OR5H15A6NDH6 313 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 VHLP40337 213 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ARG2P78540 354 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CHRNB3Q05901 458 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 EFR3AQ14156 821 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 GPR68Q15743 365 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 FLYWCH1Q4VC44 716 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 REEP3Q6NUK4 255 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CBLL1Q75N03 491 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 LILRA2Q8N149 483 aa27.15■■□□□ 1.94
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