RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 PIGNO95427 931 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 LIPCP11150 499 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 F3P13726 295 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 CTSEP14091 401 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 CDH3P22223 829 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 CLDN17P56750 224 aa4.95□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 SLC36A3Q495N2 470 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 ZNF542PQ5EBM4 170 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 RABGAP1LQ5R372 815 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 NKAIN2Q5VXU1 208 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.95□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 STK40Q8N2I9 435 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 CCDC112Q8NEF3 446 aa4.95□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 GPR137Q96N19 417 aa4.95□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 EGLN1Q9GZT9 426 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 ADNPQ9H2P0 1102 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 C5orf66Q9H5L9 145 aa4.95□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 ACTR8Q9H981 624 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 LRRC40Q9H9A6 602 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 COG4Q9H9E3 785 aa4.95□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 NMUR1Q9HB89 426 aa4.95□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 ABCC13Q9NSE7 274 aa4.95□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 CHMP2BQ9UQN3 213 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 NBEAQ8NFP9 2946 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.95□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 FREM2Q5SZK8 3169 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 CKAP5Q14008 2032 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 LAMA1P25391 3075 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 TMEM89A2RUT3 159 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 C5orf60A6NFR6 353 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 F5H5T6 163 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 H3BMM5 538 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 FPGTO14772 594 aa4.94□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 TBX19O60806 448 aa4.94□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 KDM4BO94953 1096 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 RRASP10301 218 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 GJB2P29033 226 aa4.94□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 SLC20A2Q08357 652 aa4.94□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 SLC35D3Q5M8T2 416 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 FHL5Q5TD97 284 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa4.94□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 FJX1Q86VR8 437 aa4.94□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 LRRC17Q8N6Y2 441 aa4.94□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 C12orf29Q8N999 325 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 GLYATL1Q969I3 302 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 MAGED4Q96JG8 741 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 PKNOX2Q96KN3 472 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 SERPINB11Q96P15 392 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 DUSP16Q9BY84 665 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 GANQ9H2C0 597 aa4.94□□□□□ -1.62
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