RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 GPR137CQ8N3F9 429 aa10.46□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 IL17RCQ8NAC3 791 aa10.46□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 CREB3L4Q8TEY5 395 aa10.46□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 LURAP1Q96LR2 239 aa10.46□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 VPS25Q9BRG1 176 aa10.46□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 KCNK13Q9HB14 408 aa10.46□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 GPRC5BQ9NZH0 403 aa10.46□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 ASB4Q9Y574 426 aa10.46□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 HLA-EP13747 358 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 APEHP13798 732 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 OR4C11Q6IEV9 310 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 ASPGQ86U10 573 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 OR4N5Q8IXE1 308 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 DDIT4LQ96D03 193 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 RADILQ96JH8 1075 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 MRIQ9BWK5 157 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 CWH43Q9H720 699 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 AIG1Q9NVV5 245 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 C2orf72A6NCS6 295 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 DVL2O14641 736 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 BMP4P12644 408 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 SCAPQ12770 1279 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 OR52H1Q8NGJ2 320 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 SFXN5Q8TD22 340 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 LTN1O94822 1766 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM227AF5H4B4 570 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 B4GAT1O43505 415 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 SCNN1AP37088 669 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 WNT4P56705 351 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 INAVAQ3KP66 663 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 UGT3A2Q3SY77 523 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 UBE2NLQ5JXB2 153 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM164Q5U3C3 297 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 TPRG1Q6ZUI0 275 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 MR1Q95460 341 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC29A1Q99808 456 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 GPR88Q9GZN0 384 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 POPDC3Q9HBV1 291 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 BCL9LQ86UU0 1499 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 AQP9O43315 295 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 ASGR2P07307 311 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 ARSBP15848 533 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 TSFMP43897 325 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 GAB1Q13480 694 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 BCL7AQ4VC05 210 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 IER5LQ5T953 404 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 APOOLQ6UXV4 268 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 NRMQ8IXM6 262 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 RNF128Q8TEB7 428 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 TFAP2CQ92754 450 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 F2RL3Q96RI0 385 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF416Q9BWM5 594 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 SMCO4Q9NRQ5 59 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 ZFP57Q9NU63 452 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 CNIH4Q9P003 139 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 PRODH2Q9UF12 536 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 SEC14L5O43304 696 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 HLA-DMAP28067 261 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 GBX1Q14549 363 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 PDZD11Q5EBL8 140 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 AVPI1Q5T686 147 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 TEX26Q8N6G2 289 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 B3GNT7Q8NFL0 401 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 CBY3A6NI87 242 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 OSMP13725 252 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF30P17039 623 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 FPGSQ05932 587 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC14A1Q13336 389 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 GPR50Q13585 617 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 HNF4GQ14541 408 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 DPPA2Q7Z7J5 298 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 BAGE3Q86Y29 109 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 BAGE2Q86Y30 109 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 CHTF18Q8WVB6 975 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 PTCHD1Q96NR3 888 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF286AQ9HBT8 521 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 THSD1Q9NS62 852 aa10.45□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa10.44□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 FKTNO75072 461 aa10.44□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 HSD17B1P14061 328 aa10.44□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 RAB3AP20336 220 aa10.44□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 NKX3-2P78367 333 aa10.44□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC9A3R2Q15599 337 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms