RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 C1orf210Q8IVY1 113 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 GPR135Q8IZ08 494 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 OR2I1PQ8NGU4 316 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 C16orf52Q8NHV5 167 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 NDC1Q9BTX1 674 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 POLE3Q9NRF9 147 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.58■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 CDHR4A6H8M9 788 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 A8MUA0 341 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
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ACTB-201ENST00000331789 COX10Q12887 443 aa16.58■□□□□ 0.24
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ACTB-201ENST00000331789 C1orf189Q5VU69 101 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 C12orf73Q69YU5 71 aa16.58■□□□□ 0.24
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ACTB-201ENST00000331789 ARSGQ96EG1 525 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 SIGLEC11Q96RL6 698 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 IL4I1Q96RQ9 567 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 COPS4Q9BT78 406 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 GAREM1Q9H706 876 aa16.58■□□□□ 0.24
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ACTB-201ENST00000331789 FGF21Q9NSA1 209 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 SLC7A7Q9UM01 511 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 C17orf105B2RV13 164 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 H3BMQ9 156 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ATE1O95260 518 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 CCL7P80098 99 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 TEKQ02763 1124 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 MVKQ03426 396 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 DECR1Q16698 335 aa16.57■□□□□ 0.24
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ACTB-201ENST00000331789 PRSS48Q7RTY5 328 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 C11orf74Q86VG3 221 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 TMEM255BQ8WV15 326 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PMM1Q92871 262 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 COG8Q96MW5 612 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 DOK1Q99704 481 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD19PQ9H560 264 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 FKBP14Q9NWM8 211 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 GPR83Q9NYM4 423 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 SELENONQ9NZV5 590 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 CNIH4Q9P003 139 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 NUP210LQ5VU65 1888 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 CLCA1A8K7I4 914 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PATE3B3GLJ2 98 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
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ACTB-201ENST00000331789 SOX30O94993 753 aa16.57■□□□□ 0.24
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF321PQ8N8H1 164 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 MVB12AQ96EY5 273 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ITPAQ9BY32 194 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 DSN1Q9H410 356 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZNF304Q9HCX3 659 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PQM1 296 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 DSCR3O14972 297 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 CT45A8P0DMV1 189 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 CT45A9P0DMV2 189 aa16.56■□□□□ 0.24
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