RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASL10BQ96S79 203 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL28Q9NXS3 571 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEKT2Q9UIF3 430 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARGFXA6NJG6 315 aa25.26■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FESP07332 822 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD247P20963 164 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSR4P51571 173 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 MLF1P58340 268 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIPR1Q53HC9 387 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPN5Q6U736 354 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIRT6Q8N6T7 355 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASB15Q8WXK1 588 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF354BQ96LW1 612 aa25.26■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 DKK4Q9UBT3 224 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 SH3GLB1Q9Y371 365 aa25.26■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 WT1P19544 449 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDC20Q12834 499 aa25.25■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF141Q15928 474 aa25.25■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 H3F3CQ6NXT2 135 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa25.25■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 H0Y3Z8 333 aa25.24■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RCN1Q15293 331 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPK14Q16539 360 aa25.24■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GRAMD1BQ3KR37 738 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM156Q8N614 296 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5M3Q8NGP4 307 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4C3Q8NH37 302 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLCO4A1Q96BD0 722 aa25.24■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CHID1Q9BWS9 393 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARMC1Q9NVT9 282 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPIPB9F8W1W9 429 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ICOSLGO75144 302 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGT2B11O75310 529 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 BAG2O95816 211 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBXA2RP21731 343 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNJ10P78508 379 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ARMC10Q8N2F6 343 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR32P1Q8NGA4 272 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNE5Q9UJ90 142 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 DTNAQ9Y4J8 743 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 H3BNH8 94 aa25.22■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO45P0C2W1 286 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLK3P49761 638 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXW4P57775 412 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZSWIM7Q19AV6 140 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF836Q6ZNA1 936 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ABI3Q9P2A4 366 aa25.22■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM229AB2RXF0 380 aa25.22■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa25.22■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TP53I11O14683 189 aa25.21■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NGFRP08138 427 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFRSF1BP20333 461 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1E2P47887 323 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPP38P78345 283 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABHD17BQ5VST6 288 aa25.21■■□□□ 1.63
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