RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 KATNB1Q9BVA0 655 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 EVA1BQ9NVM1 165 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 B3GALT2O43825 422 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 PLOD3O60568 738 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 CLEC2LP0C7M8 214 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 IFNA8P32881 189 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 GPR4P46093 362 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 CDH11P55287 796 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 FABP5Q01469 135 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 MGAT2Q10469 447 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 GPR50Q13585 617 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 SDE2Q6IQ49 451 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 FIGLAQ6QHK4 219 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 WDR88Q6ZMY6 472 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF619Q8N2I2 560 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 OR52N1Q8NH53 320 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 GATAD2BQ8WXI9 593 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 KCTD7Q96MP8 289 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 STACQ99469 402 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 ACTR10Q9NZ32 417 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 NLGN3Q9NZ94 848 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 CLEC1BQ9P126 229 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 KCNE5Q9UJ90 142 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 SLC7A7Q9UM01 511 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4C-201ENST00000317868 URADA6NGE7 173 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 CYR61O00622 381 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 LRRTM2O43300 516 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 APOL3O95236 402 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 TSPAN19P0C672 248 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 ACTR1BP42025 376 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 ACTR1AP61163 376 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 SHHQ15465 462 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 MAPK14Q16539 360 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 DEFB134Q4QY38 66 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 AKAP14Q86UN6 197 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 SIPA1Q96FS4 1042 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 MRGPRX1Q96LB2 322 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 SOSTQ9BQB4 213 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 KLHL25Q9H0H3 589 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 DUSP22Q9NRW4 184 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 NUP210LQ5VU65 1888 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 DYRK3O43781 588 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 FMO6PO60774 539 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 TBXA2RP21731 343 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 GALP22466 123 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 LSSP48449 732 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 GPR18Q14330 331 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 ALG11Q2TAA5 492 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 ABHD13Q7L211 337 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 OR4N4Q8N0Y3 316 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 SHISA5Q8N114 240 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 CAMKVQ8NCB2 501 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM52Q8NDY8 209 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 CTHRC1Q96CG8 243 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 COQ7Q99807 217 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 BHLHE40O14503 412 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 SLC30A4O14863 429 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 IL7P13232 177 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 NDUFV2P19404 249 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 SDC2P34741 201 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 RUNX1T1Q06455 604 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 DSG2Q14126 1118 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 EOGTQ5NDL2 527 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 AGAP6Q5VW22 663 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 BBS1Q8NFJ9 593 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 OR2T33Q8NG76 320 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 PMM1Q92871 262 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 AGAP4Q96P64 663 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 TIMP4Q99727 224 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 ABCB9Q9NP78 766 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 FAM221BA6H8Z2 402 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 DBIP07108 87 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 NID1P14543 1247 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 ACSL1P33121 698 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 SRP54P61011 504 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 HTR4Q13639 388 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 KCNJ8Q15842 424 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 MANEAQ5SRI9 462 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 DCST2Q5T1A1 773 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 XKRXQ6PP77 449 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4C-201ENST00000317868 SPATC1Q76KD6 591 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms