RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPRKBQ9Y3C4 175 aa20.26■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A087WUU8 490 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 H3BSA7 217 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HTR1AP08908 422 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC37A1P57057 533 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DAB2P98082 770 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZER1Q7Z7L7 766 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM151BQ8IW70 566 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR4N2Q8NGD1 307 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RHOXF1Q8NHV9 184 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR6C1Q96RD1 312 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITPAQ9BY32 194 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DUSP21Q9H596 190 aa20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPIPA7E9PJI5 369 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPIPB9F8W1W9 429 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGKV3-11P04433 115 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPIPA8P0DM63 369 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMP11P24347 488 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FMO3P31513 532 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFNGR2P38484 337 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFNA3P52797 238 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOXC5Q00444 222 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF141Q15928 474 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DECR1Q16698 335 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSWIM7Q19AV6 140 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VWA2Q5GFL6 755 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR141Q7Z602 305 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLITRK4Q8IW52 837 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBE2FQ969M7 185 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC41A3Q96GZ6 507 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC46A1Q96NT5 459 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASSF1Q9NS23 344 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCN3BQ9NY72 215 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTTG2Q9NZH5 202 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RARRES3Q9UL19 164 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CBLCQ9ULV8 474 aa20.24■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XPNPEP2O43895 674 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF883P0CG24 379 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GABRB1P18505 474 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSTM3P21266 225 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DRD5P21918 477 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTKP33981 857 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC35A2P78381 396 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANGPT1Q15389 498 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBED5Q49AG3 693 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COX15Q7KZN9 410 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GDF7Q7Z4P5 450 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPARTQ8N0X7 666 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC35B4Q969S0 331 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LOXL4Q96JB6 756 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC22A11Q9NSA0 550 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFL2Q9Y281 166 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VPS13AQ96RL7 3174 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDAH2O95865 285 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THY1P04216 161 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TP53P04637 393 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT20P35900 424 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDC42P60953 191 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLAURQ03405 335 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLPP5Q8NEB5 264 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR14A16Q8NHC5 309 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SGCDQ92629 289 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NODALQ96S42 347 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VN1R1Q9GZP7 353 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AASSQ9UDR5 926 aa20.23■□□□□ 0.83
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MPZL2O60487 215 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms