RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COL21A1Q96P44 957 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SDF2Q99470 211 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TOR3AQ9H497 397 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COPS7AQ9UBW8 275 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRODH2Q9UF12 536 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SH3GLB1Q9Y371 365 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NPIPA7E9PJI5 369 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYC1P08574 325 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NPIPA8P0DM63 369 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RRM2P31350 389 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNC4Q03721 635 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LIN52Q52LA3 116 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF220Q5VTB9 566 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C7orf57Q8NEG2 295 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR32P1Q8NGA4 272 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR11G2Q8NGC1 345 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PROX1Q92786 737 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ART5Q96L15 291 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EXD2Q9NVH0 621 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LIPT1Q9Y234 373 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ORC6Q9Y5N6 252 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ENPP4Q9Y6X5 453 aa22.06■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPTBN2O15020 2390 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A0G2JPF8 293 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRABD2BA6NFA1 517 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNK2O95069 426 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FESP07332 822 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ETS2P15036 469 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNJ5P48544 419 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAD23AP54725 363 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTC23Q5W5X9 447 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MBOAT4Q96T53 435 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SEMA4CQ9C0C4 833 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM118AQ9NWS6 357 aa22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C21orf140B9A014 251 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAJB5O75953 348 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AGR2O95994 175 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IFNW1P05000 195 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PAX7P23759 505 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FRRS1Q6ZNA5 592 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRR22Q8IZ63 422 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BTBD2Q9BX70 525 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WWTR1Q9GZV5 400 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SEC14L3Q9UDX4 400 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LAPTM4AQ15012 233 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGF2-ASQ6U949 168 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF555Q8NEP9 628 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIP5K1AQ99755 562 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CALML5Q9NZT1 146 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TESMINQ9Y4I5 508 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNFRSF11BO00300 401 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DXOO77932 396 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLIC3O95833 236 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD63P08962 238 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RHCEP18577 417 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGFBP5P24593 272 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DAPP51397 102 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF4P78317 190 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SSPNQ14714 243 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RTP5Q14D33 572 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR68Q15743 365 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BTBD16Q32M84 506 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KDM4DQ6B0I6 523 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DESI1Q6ICB0 168 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VASH2Q86V25 355 aa22.03■■□□□ 1.12
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