RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 GPR139Q6DWJ6 353 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 FBXL22Q6P050 247 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 B3GNT9Q6UX72 402 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 LINGO4Q6UY18 593 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF384Q8TF68 577 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC74AQ96AQ1 378 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 PIGQQ9BRB3 760 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 SLC22A31A6NKX4 558 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 UPK3BL1B0FP48 263 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 UPK3BL2E5RIL1 263 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGAP33O14559 1287 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ANKRD28O15084 1053 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 SOD2P04179 222 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 SLURP2P0DP57 97 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 SOX2P48431 317 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 CHRFAM7AQ494W8 412 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF679Q8IYX0 411 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 DNAJC22Q8N4W6 341 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 FBRSQ9HAH7 460 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 TSPAN11A1L157 253 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 OR2T1O43869 369 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF623O75123 536 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 CDK3Q00526 305 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 SLAMF1Q13291 335 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 SPIN3Q5JUX0 258 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 PDZD3Q86UT5 571 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 LIX1LQ8IVB5 337 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 C1orf87Q8N0U7 546 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 IL17RDQ8NFM7 739 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 OR51D1Q8NGF3 324 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 TRIB2Q92519 343 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 IL21RQ9HBE5 538 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 VAPAQ9P0L0 249 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 PIRO00625 290 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ADH1BP00325 375 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 SLC6A6P31641 620 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGAP40Q5TG30 622 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM81Q6P7N7 255 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 APOOLQ6UXV4 268 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 OR6F1Q8NGZ6 308 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 OR5AK3PQ8NH89 298 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF461Q8TAF7 563 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 YIPF5Q969M3 257 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC74BQ96LY2 380 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 NEUROD4Q9HD90 331 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 MIOXQ9UGB7 285 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 OSGIN1Q9UJX0 560 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 RCE1Q9Y256 329 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 WIF1Q9Y5W5 379 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 G3V2L1 256 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ACOT8O14734 319 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 OR2C1O95371 312 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 HLA-DQB2P05538 268 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 MLLT10P55197 1068 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 OR2B8PP59922 312 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 HTD2P86397 168 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 UNC50Q53HI1 259 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 OTOP2Q7RTS6 562 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 PRRG4Q9BZD6 226 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ACOXLQ9NUZ1 547 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ARGFXA6NJG6 315 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF208O43345 1280 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 TFPIP10646 304 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 DDOQ99489 341 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 RASD1Q9Y272 281 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 PRAMEF11O60813 436 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 BPNT1O95861 308 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 GLO1Q04760 184 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 NUP54Q7Z3B4 507 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 OR5M8Q8NGP6 311 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 V9GYS6 101 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 OR2A25A4D2G3 310 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 A8MXE2 369 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 HAAOP46952 286 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 FABP6P51161 128 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 PSPHP78330 225 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 MFSD13AQ14CX5 517 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ALG10BQ5I7T1 473 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 UQCC3Q6UW78 93 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 SLC29A4Q7RTT9 530 aa13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms