RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PRMT3O60678 531 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 FPR1P21462 350 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ARFIP1P53367 373 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 HOXC5Q00444 222 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ABHD18Q0P651 414 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PRSS42Q7Z5A4 293 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 RDH10Q8IZV5 341 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 LRRN3Q9H3W5 708 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 IL1RAPQ9NPH3 570 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SEMA5BQ9P283 1151 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SLC23A1Q9UHI7 598 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTS20P59510 1910 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 A0A075B6Q4 140 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CLCA1A8K7I4 914 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 FLRT2O43155 660 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 IL32P24001 234 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CERS1P27544 350 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 MC1RQ01726 317 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 KCNAB1Q14722 419 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 XKRXQ6PP77 449 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 MMP21Q8N119 569 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SRRQ9GZT4 340 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 C3orf14Q9HBI5 128 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 FAM86C1Q9NVL1 165 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R16Q9NYV7 291 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 RFXANKO14593 260 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 IL3P08700 152 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SMIM10L1P0DMW3 83 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 VLDLRP98155 873 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 FAM71E1Q6IPT2 247 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 FAM122CQ6P4D5 195 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM71Q6P5X7 295 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ACOT4Q8N9L9 421 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TM4SF18Q96CE8 201 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SMIM10Q96HG1 83 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 COL21A1Q96P44 957 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PITX2Q99697 317 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 EDEM2Q9BV94 578 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SEMA4GQ9NTN9 838 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 B3GNT2Q9NY97 397 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PLD2O14939 933 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 C1QBP02746 253 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 FHP07954 510 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 COX7A2P14406 83 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PRKACAP17612 351 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 BTN3A2P78410 334 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TGM3Q08188 693 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 QPRTQ15274 297 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TSTQ16762 297 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 OR4F3Q6IEY1 312 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 OR8H1Q8NGG4 311 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJB8Q8NHS0 232 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PLCL2Q9UPR0 1127 aa18.98■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 GABRR3A8MPY1 467 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 A8MUA0 341 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 I3L521 148 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TSFMP43897 325 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 HSD11B2P80365 405 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SNTA1Q13424 505 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 MED22Q15528 200 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 MANEAQ5SRI9 462 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 RHBDD1Q8TEB9 315 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CNPPD1Q9BV87 410 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 NIPAL2Q9H841 368 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SCN3AQ9NY46 2000 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL21Q9UJP4 597 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 URADA6NGE7 173 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 FABP3P05413 133 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 NAT2P11245 290 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CD59P13987 128 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CTAG1AP78358 180 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 OLR1P78380 273 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 C2orf80Q0P641 193 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ASAH1Q13510 395 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 DEFB134Q4QY38 66 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CCNJQ5T5M9 372 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 IKBIPQ70UQ0 350 aa18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms