RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ATPIF1Q9UII2 106 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ANTXRLA6NF34 631 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
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TRPS1-201ENST00000220888 PVRP15151 417 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 RAB3AP20336 220 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 OR1D4P47884 311 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 CLDN8P56748 225 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 GPX6P59796 221 aa9.96□□□□□ -0.81
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TRPS1-201ENST00000220888 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 OR1S1Q8NH92 325 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
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TRPS1-201ENST00000220888 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
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TRPS1-201ENST00000220888 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 WIF1Q9Y5W5 379 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 PSAT1Q9Y617 370 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 LDB3O75112 727 aa9.96□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 COL28A1Q2UY09 1125 aa9.96□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 OR5T1Q8NG75 326 aa9.96□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 IL1F10Q8WWZ1 152 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 FDXRP22570 491 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CDKN2CP42773 168 aa9.95□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 MSS51Q4VC12 460 aa9.95□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF585AQ6P3V2 769 aa9.95□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 IL17RDQ8NFM7 739 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 BOD1Q96IK1 185 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF649Q9BS31 505 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 OPA3Q9H6K4 179 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CBLCQ9ULV8 474 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 LHX6Q9UPM6 363 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ETFAP13804 333 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 TSFMP43897 325 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ACTBP60709 375 aa9.95□□□□□ -0.82
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