RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4_PAR_Y

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.55□□□□□ -0.08
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KRT6AP02538 564 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KRT6BP04259 564 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y THBDP07204 575 aa14.55□□□□□ -0.08
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MPIP34949 423 aa14.55□□□□□ -0.08
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.55□□□□□ -0.08
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ALKBH2Q6NS38 261 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MARCH3Q86UD3 253 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y WFDC8Q8IUA0 241 aa14.55□□□□□ -0.08
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CAVIN3Q969G5 261 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EMC9Q9Y3B6 208 aa14.55□□□□□ -0.08
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SHISA8B8ZZ34 492 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KLF4O43474 513 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FADS1O60427 444 aa14.54□□□□□ -0.08
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ULK1O75385 1050 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SUPT7LO94864 414 aa14.54□□□□□ -0.08
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ABHD2P08910 425 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FCGR2AP12318 317 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HSD3B1P14060 373 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HSD3B2P26439 372 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HSD17B3P37058 310 aa14.54□□□□□ -0.08
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CTBP2P56545 445 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CLCQ05315 142 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BTKQ06187 659 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ACSM2AQ08AH3 577 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DECR1Q16698 335 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ACSM2BQ68CK6 577 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SH2D5Q6ZV89 423 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y METTL6Q8TCB7 284 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RTN4RQ9BZR6 473 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF225Q9UK10 706 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CRLF1O75462 422 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y JUNP05412 331 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PPP3CBP16298 524 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HMOX2P30519 316 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TNK1Q13470 666 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RASA2Q15283 850 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMEM107Q6UX40 140 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y METTL25Q8N6Q8 603 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PLPPR2Q96GM1 343 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y APIPQ96GX9 242 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NFU1Q9UMS0 254 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y OPN1LWP04000 364 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SBK3P0C264 359 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TAC1P20366 129 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC6A8P48029 635 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C2orf80Q0P641 193 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GUSBP1Q15486 140 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SPIN4Q56A73 249 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y STAC2Q6ZMT1 411 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TIFABQ6ZNK6 161 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LCA5Q86VQ0 697 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IFT20Q8IY31 132 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y OR6K3Q8NGY3 331 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KIF18AQ8NI77 898 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ACPTQ9BZG2 426 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y Q9N2J8 555 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FANCFQ9NPI8 374 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
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