RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 LINC01387J3KSC0 135 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 AQP8O94778 261 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 KRT6AP02538 564 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 KRT6BP04259 564 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 THBDP07204 575 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 MPIP34949 423 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 KRT6CP48668 564 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 ATP5J2P56134 94 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 BEX5Q5H9J7 111 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 LGSNQ5TDP6 509 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 MARCH3Q86UD3 253 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 CAVIN3Q969G5 261 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 EBPLQ9BY08 206 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.55□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 HIVEP2P31629 2446 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 A8MT66 165 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 KLF4O43474 513 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 FADS1O60427 444 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 PLOD3O60568 738 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 COQ9O75208 318 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 ULK1O75385 1050 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 SUPT7LO94864 414 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 PLAUP00749 431 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 ABHD2P08910 425 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 FCGR2AP12318 317 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 HSD3B1P14060 373 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 HSD3B2P26439 372 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 HSD17B3P37058 310 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 CTBP2P56545 445 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 PSG6Q00889 435 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 CLCQ05315 142 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 BTKQ06187 659 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 DECR1Q16698 335 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 METTL6Q8TCB7 284 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 ZNF225Q9UK10 706 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.54□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 CRLF1O75462 422 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 JUNP05412 331 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 PPP3CBP16298 524 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 HMOX2P30519 316 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 TNK1Q13470 666 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 RASA2Q15283 850 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 TMEM107Q6UX40 140 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 APIPQ96GX9 242 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 NFU1Q9UMS0 254 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.53□□□□□ -0.08
CD99-211ENST00000623253 OPN1LWP04000 364 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 SBK3P0C264 359 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 TAC1P20366 129 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 SLC6A8P48029 635 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 C2orf80Q0P641 193 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 GUSBP1Q15486 140 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 SPIN4Q56A73 249 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 LCA5Q86VQ0 697 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 IFT20Q8IY31 132 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 KIF18AQ8NI77 898 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 ACPTQ9BZG2 426 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 Q9N2J8 555 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 FANCFQ9NPI8 374 aa14.52□□□□□ -0.09
CD99-211ENST00000623253 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms