RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PTGES2Q9H7Z7 377 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC151A5D8V7 595 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 C16orf97H3BN30 126 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 SEC14L5O43304 696 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 PSMG1O95456 288 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 LY6G6DO95868 133 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 JUNP05412 331 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 ROS1P08922 2347 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 FPR1P21462 350 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 GCAP28676 217 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.182e-6■■□□□ 12.6
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN20P56880 219 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF763Q0D2J5 394 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 C2orf80Q0P641 193 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 STX5Q13190 355 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 FGFBP1Q14512 234 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 GUSBP1Q15486 140 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 DECR1Q16698 335 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM107Q6UX40 140 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A9Q8IVM8 553 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 DUSP19Q8WTR2 217 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 PCNX3Q9H6A9 2034 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 UBTD1Q9HAC8 227 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 TAS2R7Q9NYW3 318 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 UPK1AO00322 258 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 KCNJ5P48544 419 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 OCRLQ01968 901 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 PON3Q15166 354 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 SPDYAQ5MJ70 313 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF550Q7Z398 422 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 OR2L13Q8N349 312 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF610Q8N9Z0 462 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 CCL19Q99731 98 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 PIGQQ9BRB3 760 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 CSPG4Q6UVK1 2322 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 H3BML4 177 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 H7C1Q1 480 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 IL33O95760 270 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 LOXP28300 417 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 FAM71E1Q6IPT2 247 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 C22orf34Q6ZV56 151 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 MARCH3Q86UD3 253 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 METTL25Q8N6Q8 603 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 CDC26Q8NHZ8 85 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 Q96MF0 132 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 HS3ST6Q96QI5 342 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 GLIPR2Q9H4G4 154 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 Q9N2J8 555 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 CLK3P49761 638 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 C20orf204Q6ZNR8 217 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 ELP4Q96EB1 424 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 GSTO2Q9H4Y5 243 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 MIEF1Q9NQG6 463 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 PROCRQ9UNN8 238 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 AP4B1Q9Y6B7 739 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 DSCAMO60469 2012 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 ABHD2P08910 425 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 FOXA1P55317 472 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM44Q2T9K0 475 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 FAM214BQ7L5A3 538 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 CAVIN3Q969G5 261 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 AMDHD1Q96NU7 426 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 BDH2Q9BUT1 245 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 MYNNQ9NPC7 610 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 AQP8O94778 261 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 TBXA2RP21731 343 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 NTSP30990 170 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 C17orf67Q0P5P2 114 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 APOOLQ6UXV4 268 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT8Q8WV74 236 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PERPQ96FX8 193 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 MID1IP1Q9NPA3 183 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 HIVEP2P31629 2446 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 UTS2O95399 124 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 FCGR2AP12318 317 aa22.38■■□□□ 1.17
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