RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 HBQ1P09105 142 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF77Q15935 545 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 FRMPD2BQ6IN97 320 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ZER1Q7Z7L7 766 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ASB16Q96NS5 453 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 OR7D2Q96RA2 312 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TUBB1Q9H4B7 451 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 LRIT1Q9P2V4 623 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 NOX1Q9Y5S8 564 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 DOCK2Q92608 1830 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 B4GALT3O60512 393 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ARAFP10398 606 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 EMP2P54851 167 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 GALK2Q01415 458 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ACVR1Q04771 509 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 MAB21L1Q13394 359 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PDFQ9HBH1 243 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 YES1P07947 543 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CLUP10909 449 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CPMP14384 443 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PLP2Q04941 152 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEFF1Q8IYR6 380 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 MYEOVQ96EZ4 313 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 MEMO1Q9Y316 297 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SEC14L5O43304 696 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 FUT1P19526 365 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 DPP6P42658 865 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 BTBD16Q32M84 506 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 LRIF1Q5T3J3 769 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 EPHX3Q9H6B9 360 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 GFRA2O00451 464 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CD97P48960 835 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 RIDAP52758 137 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ARAP2Q8WZ64 1704 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF576Q9H609 170 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TM7SF3Q9NS93 570 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PAPPAQ13219 1627 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PRKCDQ05655 676 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 OR8S1Q8NH09 359 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ADOQ96SZ5 270 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ERVK13-1Q9NX77 482 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 VNN3Q9NY84 501 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL21Q9UJP4 597 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SH3PXD2BA1X283 911 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM171A2A8MVW0 826 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB2AP61019 212 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CHRDL2Q6WN34 429 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 VRK2Q86Y07 508 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SPARTQ8N0X7 666 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 NXPE2Q96DL1 559 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SCGB3A2Q96PL1 93 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 B4GALT7Q9UBV7 327 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAM29Q9UKF5 820 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDH17O14917 1159 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CXCL10P02778 98 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 STOMP27105 288 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC54Q8NEL0 328 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC6A17Q9H1V8 727 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 WNT4P56705 351 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PFN3P60673 137 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ERV3-1Q14264 604 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM69Q5SWH9 247 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 LYSMD4Q5XG99 296 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA0895LQ68EN5 471 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PLAG1Q6DJT9 500 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 LILRA2Q8N149 483 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ARPC4P59998 168 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 GK3PQ14409 553 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 NLGN4XQ8N0W4 816 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 FCAMRQ8WWV6 532 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF224Q9NZL3 707 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM202A6NGA9 273 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 P04436 131 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CTHP32929 405 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PODNL1Q6PEZ8 512 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PELI3Q8N2H9 469 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SFXN5Q8TD22 340 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 A6NHS1 94 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRJ-208ENST00000615445 RBBP9O75884 186 aa19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms