RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 DCTN3O75935 186 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 OR2J2O76002 312 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 UBOX5O94941 541 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 TJP3O95049 919 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SNAPINO95295 136 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PGM3O95394 542 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NSA2O95478 260 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 FTCDO95954 541 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PLATP00750 562 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 EPOP01588 193 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 CD8AP01732 235 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 APOA1P02647 267 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 GLAP06280 429 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 THBDP07204 575 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 FHP07954 510 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 H2AFZP0C0S5 128 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 CCL3P10147 92 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 CYP4B1P13584 511 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 HSD3B1P14060 373 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PKMP14618 531 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ITGALP20701 1170 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PTPN3P26045 913 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 IL1R2P27930 398 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PSMB5P28074 263 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 RRM2P31350 389 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 GP5P40197 560 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 VHLP40337 213 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SOX3P41225 446 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 LIMS1P48059 325 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SLC6A12P48065 614 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 KCNJ5P48544 419 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 CCT3P49368 545 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 CLK3P49761 638 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 GSK3AP49840 483 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 KLK7P49862 253 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 HNMTP50135 292 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 CCR8P51685 355 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 GPR143P51810 404 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SLC18A1P54219 525 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 P2RX3P56373 397 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 AP1S2P56377 157 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ATP6V0D1P61421 351 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NAA20P61599 178 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PRAMEP78395 509 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ABATP80404 500 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 XIAPP98170 497 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 CAV1Q03135 178 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PCDH1Q08174 1060 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 STX5Q13190 355 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 MMRN1Q13201 1228 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 MAMLD1Q13495 774 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 DYRK1AQ13627 763 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NFYCQ13952 458 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SCARB2Q14108 478 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 DOC2BQ14184 412 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 RCAN2Q14206 197 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SPARCL1Q14515 664 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SLC29A2Q14542 456 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NOMO1Q15155 1222 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 RAB35Q15286 201 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 TRADDQ15628 312 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 DPYSL2Q16555 572 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NRF1Q16656 503 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PHKG1Q16816 387 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 AARDQ4LEZ3 155 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 FAM209BQ5JX69 171 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SIRPB2Q5JXA9 342 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 HECTD2Q5U5R9 776 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 RNF220Q5VTB9 566 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SLC22A10Q63ZE4 541 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 DUPD1Q68J44 220 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 OR52E8Q6IFG1 317 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SULT1C3Q6IMI6 304 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 RTL4Q6ZR62 310 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 USP43Q70EL4 1123 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 H2AFVQ71UI9 128 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 MON1BQ7L1V2 547 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NLRC3Q7RTR2 1065 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 TAS2R42Q7RTR8 314 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NUP54Q7Z3B4 507 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PRUNE1Q86TP1 453 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ZBTB46Q86UZ6 589 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 LRRC6Q86X45 466 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 GPSM1Q86YR5 675 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 TREML1Q86YW5 311 aa2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.5 ms