RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395		A8MVJ9	347 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395		G3V2T6	193 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ADAMDEC1	O15204	470 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	E2F6	O75461	281 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SERPINB7	O75635	380 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DNAJB5	O75953	348 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DIRAS1	O95057	198 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ALPL	P05186	524 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	FES	P07332	822 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ALOX5	P09917	674 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ITGA2	P17301	1181 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	FPR1	P21462	350 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	CASR	P41180	1078 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	MAP3K8	P41279	467 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	OR1E2	P47887	323 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	KCNJ5	P48544	419 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ALDH3A2	P51648	485 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	HPCA	P84074	193 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	RHAG	Q02094	409 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	TGIF1	Q15583	401 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DUSP7	Q16829	419 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PHF19	Q5T6S3	580 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	C1orf189	Q5VU69	101 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	STK32C	Q86UX6	486 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SLC9A6	Q92581	669 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PROX1	Q92786	737 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	CDS1	Q92903	461 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	RIT1	Q92963	219 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	OR6C1	Q96RD1	312 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF347	Q96SE7	839 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	STAC	Q99469	402 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PINK1	Q9BXM7	581 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PIGU	Q9H490	435 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	RARRES3	Q9UL19	164 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	HRK	O00198	91 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SYT5	O00445	386 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	KIAA0513	O60268	411 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PRAMEF2	O60811	474 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SCRG1	O75711	98 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SOX30	O94993	753 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	NKX2-2	O95096	273 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	TIAF1	O95411	115 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	AK1	P00568	194 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	CLPS	P04118	112 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	IFNW1	P05000	195 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ALPP	P05187	535 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	JMJD7	P0C870	316 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	THRB	P10828	461 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	LIPC	P11150	499 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	RHCE	P18577	417 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	RRM2	P31350	389 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SSTR4	P31391	388 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SLC5A2	P31639	672 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	EMD	P50402	254 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	EFNA3	P52797	238 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PDX1	P52945	283 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PPP2R2B	Q00005	443 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	CHRNE	Q04844	493 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	FUT7	Q11130	342 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	MED21	Q13503	144 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	GK3P	Q14409	553 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PDK3	Q15120	406 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DCST2	Q5T1A1	773 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	MLIP	Q5VWP3	458 aa		6.97	□□□□□ -1.29

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