RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	EML5	Q05BV3	1969 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	THADA	Q6YHU6	1953 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PQ09	198 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	UBXN8	O00124	270 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TM9SF1	O15321	606 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TAPBP	O15533	448 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SDC3	O75056	442 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ZWINT	O95229	277 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf105	O95561	183 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PMS2P2	O95744	297 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	GUCA1C	O95843	209 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CSF2	P04141	144 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	BPGM	P07738	259 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	GIMD1	P0DJR0	217 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	MPC1L	P0DKB6	136 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CTSE	P14091	401 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	GNS	P15586	552 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	BGN	P21810	368 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	GCH1	P30793	250 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ALDH3A1	P30838	453 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CCKAR	P32238	428 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ACTR1B	P42025	376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	RGS4	P49798	205 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	C21orf59	P57076	290 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ACTR1A	P61163	376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	RPA4	Q13156	261 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PRKG2	Q13237	762 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	GRB7	Q14451	532 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TGFBI	Q15582	683 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	HLA-B	Q31612	363 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CES4A	Q5XG92	561 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	KLC3	Q6P597	504 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PARG	Q86W56	976 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	NAGS	Q8N159	534 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	LMX1A	Q8TE12	382 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PATE1	Q8WXA2	126 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	EXT2	Q93063	718 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PKP4	Q99569	1192 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PARVB	Q9HBI1	364 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	CD274	Q9NZQ7	290 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0G2JPF8	293 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934		A8MT66	165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	LMO7DN	F2Z398	122 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SLC16A5	O15375	505 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	BIRC5	O15392	142 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	OGG1	O15527	345 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	AHCYL1	O43865	530 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	KERA	O60938	352 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	SUPT3H	O75486	399 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LINS1-210	ENST00000560934	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.16	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms