RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555296.1

MED6-208, Transcript of mediator complex subunit 6, human

TSL 2

Gene MED6, Length 856 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED6-208	ENST00000555296	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	CD47	Q08722	323 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	SERTAD2	Q14140	314 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	CASD1	Q96PB1	797 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	CHAD	O15335	359 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	THRB	P10828	461 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	IL2RG	P31785	369 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	ADRA1A	P35348	466 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	GPC3	P51654	580 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	AGRN	O00468	2067 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	LANCL1	O43813	399 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	NOL4	O94818	638 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	PTGFR	P43088	359 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	TESK2	Q96S53	571 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	DPH7	Q9BTV6	452 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MED6-208	ENST00000555296	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	BCKDHA	P12694	445 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	NAPA	P54920	295 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	OSTN	P61366	133 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	TRIP10	Q15642	601 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	NIPAL3	Q6P499	406 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	CYS1	Q717R9	158 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	POLE3	Q9NRF9	147 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	VNN3	Q9NY84	501 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296		A0A1B0GUL7	405 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	CLDN3	O15551	220 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MED6-208	ENST00000555296	OR4F21	O95013	312 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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