RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ANKRD28	O15084	1053 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ZIC3	O60481	467 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	TOX	O94900	526 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	UTS2	O95399	124 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	GABRA1	P14867	456 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	TFF3	Q07654	80 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	MARCH3	Q86UD3	253 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	FADS6	Q8N9I5	356 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ACBD4	Q8NC06	268 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ASB5	Q8WWX0	329 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		18.97	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	POLQ	O75417	2590 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	SDHD	O14521	159 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	SRD5A2	P31213	254 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	GFRA1	P56159	465 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	STX5	Q13190	355 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	OR2M3	Q8NG83	312 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	FAM110B	Q8TC76	370 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	DUSP26	Q9BV47	211 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		18.96	■□□□□ 0.63
CS-222	ENST00000550996	KCNK2	O95069	426 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	KCNH1	O95259	989 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	HBA1	P69905	142 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	PRR5	P85299	388 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	PGS1	Q32NB8	556 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	NAXE	Q8NCW5	288 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	DSN1	Q9H410	356 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	THAP1	Q9NVV9	213 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	MED11	Q9P086	117 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	AHRR	A9YTQ3	701 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ACTL6A	O96019	429 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	DPP4	P27487	766 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	PTGER4	P35408	488 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	STAR	P49675	285 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	PHC1	P78364	1004 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	OCRL	Q01968	901 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	OR4C3	Q8NH37	302 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	JADE3	Q92613	823 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		18.94	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	SCN2B	O60939	215 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	EPPIN	O95925	133 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ALOX5	P09917	674 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	COX6B1	P14854	86 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	LBP	P18428	481 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	TP53BP2	Q13625	1128 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	OGFOD2	Q6N063	350 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	MAVS	Q7Z434	540 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	IFNE	Q86WN2	208 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		18.93	■□□□□ 0.62

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