RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 ZPLD1Q8TCW7 415 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 TWIST2Q8WVJ9 160 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 WDYHV1Q96HA8 205 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 UCN2Q96RP3 112 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 MECRQ9BV79 373 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 UGT2B28Q9BY64 529 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 GALNT9Q9HCQ5 603 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 NEUROD4Q9HD90 331 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 SERHLQ9NQF3 203 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 KLRF1Q9NZS2 232 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 ABCG2Q9UNQ0 655 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 WIF1Q9Y5W5 379 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 RTTNQ86VV8 2226 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 TMEM233B4DJY2 109 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 BIRC5O15392 142 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 PDPK1O15530 556 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 NME6O75414 186 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 IL33O95760 270 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 CREB1P16220 341 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 DDX5P17844 614 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 IL12BP29460 328 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 SRD5A2P31213 254 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ZNF136P52737 540 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 GFRA1P56159 465 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ZNF844Q08AG5 666 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 GAB1Q13480 694 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 EIPR1Q53HC9 387 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ZNF385BQ569K4 471 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 TMEM107Q6UX40 140 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 KIF18BQ86Y91 864 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 OR4N2Q8NGD1 307 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 CDC26Q8NHZ8 85 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 PPCDCQ96CD2 204 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 PPP3R2Q96LZ3 170 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ZIM3Q96PE6 472 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 CALHM2Q9HA72 323 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 Q9N2J8 555 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 JKAMPQ9P055 326 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ATP6V1HQ9UI12 483 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 SLC6A5Q9Y345 797 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 OR10H1Q9Y4A9 318 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ARID1AO14497 2285 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 C2orf72A6NCS6 295 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 TMEM114B3SHH9 223 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 PIP5K1BO14986 540 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 CTIFO43310 598 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ZIC3O60481 467 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 NKX2-2O95096 273 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 LY6G6DO95868 133 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 IL18BPO95998 194 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 HRGP04196 525 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 DHRS4L1P0CG22 281 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 PRPS2P11908 318 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 BCKDHAP12694 445 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 CYP4B1P13584 511 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 CHMP24386 653 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 GRK2P25098 689 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 MAPK1P28482 360 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 GCKP35557 465 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 RPL3P39023 403 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 RPL38P63173 70 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 BCL2A1Q16548 175 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 DECR1Q16698 335 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 SMU1Q2TAY7 513 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 KRT71Q3SY84 523 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 C6orf136Q5SQH8 315 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 SH2D4BQ5SQS7 431 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ENPP6Q6UWR7 440 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 CROCCP2Q86T23 111 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 NATD1Q8N6N6 113 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-221ENST00000550734 FADS6Q8N9I5 356 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms