RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 SORCS2Q96PQ0 1159 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 BTBD9Q96Q07 612 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 BPESC1Q9GZL8 116 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 ANKRA2Q9H9E1 313 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 WDR41Q9HAD4 459 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 SAYSD1Q9NPB0 183 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 A0A0J9YW62 118 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 OPN1LWP04000 364 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PCSK2P16519 638 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 EDNRAP25101 427 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PIK3CBP42338 1070 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PNLIPRP2P54317 469 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 GPX6P59796 221 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 LTB4RQ15722 352 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 CYP20A1Q6UW02 462 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 RINLQ6ZS11 566 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 ABHD3Q8WU67 409 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 CERS2Q96G23 380 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PSAT1Q9Y617 370 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PLCE1Q9P212 2302 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 TRIM77I1YAP6 450 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 TNFSF11O14788 317 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 LILRA1O75019 489 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 LYZL6O75951 148 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PGM3O95394 542 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 KRT14P02533 472 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 FEN1P39748 380 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 CDH15P55291 814 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 STX5Q13190 355 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 OR4D1Q15615 310 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 STK11Q15831 433 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 MSS51Q4VC12 460 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 LGSNQ5TDP6 509 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 ZNF544Q6NX49 715 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 TTC27Q6P3X3 843 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 TDRPQ86YL5 185 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PDPRQ8NCN5 879 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 RNF128Q8TEB7 428 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 VSTM2LQ96N03 204 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 CD244Q9BZW8 370 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PRODH2Q9UF12 536 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PRSS50Q9UI38 385 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 VWFP04275 2813 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 SYNGR4O95473 234 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 TACSTD2P09758 323 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 CD40P25942 277 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 CUL3Q13618 768 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 TIMM23BQ5SRD1 257 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 SLC22A25Q6T423 547 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 Q6ZT83 130 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 USP43Q70EL4 1123 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 NUDT13Q86X67 352 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 OR2V1Q8NHB1 315 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 MTBPQ96DY7 904 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 ZNF681Q96N22 645 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 CENPKQ9BS16 269 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 DERL2Q9GZP9 239 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 KLHL13Q9P2N7 655 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 NOTCH1P46531 2555 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-208ENST00000547298 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms