RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPC1P48995 793 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CCT3P49368 545 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 C21orf58P58505 322 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 STX1BP61266 288 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 HSF1Q00613 529 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 MGAT2Q10469 447 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PDE7AQ13946 482 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA0040Q15053 153 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 NNATQ16517 81 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 BCL2A1Q16548 175 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PGS1Q32NB8 556 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CT45A2Q5DJT8 189 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 RNFT1Q5M7Z0 435 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 LYPD8Q6UX82 237 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 Q6ZSR9 355 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 HDXQ7Z353 690 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SPATA19Q7Z5L4 167 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 EXOC3L1Q86VI1 746 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PRR22Q8IZ63 422 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 COX18Q8N8Q8 333 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD42Q8N9B4 389 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 OR5M9Q8NGP3 310 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 AGR3Q8TD06 166 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PMM1Q92871 262 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 HGDQ93099 445 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 FCRL1Q96LA6 429 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SFXN2Q96NB2 322 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GNRHR2Q96P88 292 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TTYH2Q9BSA4 534 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DUSP26Q9BV47 211 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 MECRQ9BV79 373 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 BTBD2Q9BX70 525 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PIGMQ9H3S5 423 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 RMND5AQ9H871 391 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 EQTNQ9NQ60 294 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 UBQLN4Q9NRR5 601 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ASIC5Q9NY37 505 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 NTMQ9P121 344 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CAMK2AQ9UQM7 478 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM120BA0PK00 339 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA8OA6NCC3 632 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CD8B2A6NJW9 211 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA8NF8WBI6 632 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 KLF11O14901 512 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 HDAC3O15379 428 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPAN2O60636 221 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 UGT2B11O75310 529 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 UTS2O95399 124 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TGDSO95455 350 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 IL6P05231 212 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CHRNGP07510 517 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 IDO1P14902 403 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CPN1P15169 458 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TBXA2RP21731 343 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CTSSP25774 331 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPN6P29350 595 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 S100A3P33764 101 aa5.11□□□□□ -1.59
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CLSTN3-215ENST00000544584 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 FRKP42685 505 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CPA2P48052 419 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DGKQP52824 942 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CLDN8P56748 225 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 LTB4RQ15722 352 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSWIM7Q19AV6 140 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 UGT3A2Q3SY77 523 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 HSP90B2PQ58FF3 399 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 XKR7Q5GH72 579 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 AGBL2Q5U5Z8 902 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 RAET1LQ5VY80 246 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 NXNQ6DKJ4 435 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 VASNQ6EMK4 673 aa5.11□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 C3P1Q6ZMU1 363 aa5.11□□□□□ -1.59
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