RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 GRHL3Q8TE85 626 aa15.08■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB8BQ92930 207 aa15.08■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKRD27Q96NW4 1050 aa15.08■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 TAAR6Q96RI8 345 aa15.08■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 DOHHQ9BU89 302 aa15.08■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 HOXD1Q9GZZ0 328 aa15.08■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 METTL7AQ9H8H3 244 aa15.08■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 POLE3Q9NRF9 147 aa15.08■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 FBXO34Q9NWN3 711 aa15.08■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 GID8Q9NWU2 228 aa15.08■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 ICOSLGO75144 302 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 STX11O75558 287 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 CRYABP02511 175 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 ETFAP13804 333 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 TBXA2RP21731 343 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 EVI2BP34910 448 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 PTGDSP41222 190 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 GPR85P60893 370 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 DSTNP60981 165 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 FOXO1Q12778 655 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 COLEC12Q5KU26 742 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 PRAMEF20Q5VT98 475 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 BICRALQ6AI39 1079 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 ZAR1Q86SH2 424 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 POU5F2Q8N7G0 328 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRC58Q96CX6 371 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM41AQ96HV5 264 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 FRMD6Q96NE9 622 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 OSBPL11Q9BXB4 747 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF350Q9GZX5 532 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 IL1RL2Q9HB29 575 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 UBQLN4Q9NRR5 601 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 KLRF1Q9NZS2 232 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A0G2JMM0 328 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A1W2PPB8 328 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A1W2PRS3 328 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 KIR3DP1A8MWS1 328 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 G3V3Y1 287 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 TNFRSF21O75509 655 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 DNASE1L1P49184 302 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 CLK3P49761 638 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 GAS1P54826 345 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 KCNJ2P63252 427 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 FUT5Q11128 374 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 HYAL4Q2M3T9 481 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 GRAMD1BQ3KR37 738 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM180AQ6UWF9 173 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 PACS2Q86VP3 889 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 OR4C3Q8NH37 302 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 OIT3Q8WWZ8 545 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 PMM1Q92871 262 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 ROPN1LQ96C74 230 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 RCN3Q96D15 328 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 SH3GL1Q99961 368 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 IKZF5Q9H5V7 419 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 EFCAB1Q9HAE3 211 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 HHATLQ9HCP6 504 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 ZFP64Q9NPA5 681 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 P2RX2Q9UBL9 471 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A1W2PQD3 144 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 PINLYPA6NC86 204 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ALG1L2C9J202 215 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 NPIPB9F8W1W9 429 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 FXYD1O00168 92 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 FCMRO60667 390 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 GLSO94925 669 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 TFPTP0C1Z6 253 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ATP12AP54707 1039 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 PMP22Q01453 160 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 GNA13Q14344 377 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 NANOGP8Q6NSW7 305 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 HACD2Q6Y1H2 254 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 GALNT10Q86SR1 603 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 FITM2Q8N6M3 262 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 OR8J3Q8NGG0 315 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 CPT1CQ8TCG5 803 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 FAR1Q8WVX9 515 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF597Q96LX8 424 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 TTTY12Q9BZ98 90 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 NANOGQ9H9S0 305 aa15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms