RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522907.5

MSRA-208, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, human

TSL 5

Gene MSRA, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSRA-208	ENST00000522907	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	FUT5	Q11128	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	SQLE	Q14534	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	SAXO2	Q658L1	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907		Q6ZS92	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	MIER2	Q8N344	545 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	DPP10	Q8N608	796 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	FAM110B	Q8TC76	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	SFXN5	Q8TD22	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	HGD	Q93099	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	NEURL3	Q96EH8	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	ART5	Q96L15	291 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MSRA-208	ENST00000522907		A0A096LPI6	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907		A0A1W2PP18	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	FRG2C	A6NGY1	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	WWP2	O00308	870 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	HMGN4	O00479	90 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	SLC22A2	O15244	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	EMC8	O43402	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	TSPAN2	O60636	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	FAM107A	O95990	144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ALPP	P05187	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	IL6	P05231	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	TNNI3	P19429	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ABCD3	P28288	659 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	PTGDS	P41222	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	TRPC1	P48995	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	GAS1	P54826	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	AP2B1	P63010	937 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	CHRNE	Q04844	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	FOXO1	Q12778	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	KLF10	Q13118	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ADRM1	Q16186	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	NTRK2	Q16620	822 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	DUSP5	Q16690	384 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	MEP1A	Q16819	746 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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