RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515918.1

RNU6-488P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 488, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-488P, Length 99 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-488P-201ENST00000515918 ZNF33BQ06732 778 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 C1orf61Q13536 156 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 RAB35Q15286 201 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 UPP1Q16831 310 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 TMEM44Q2T9K0 475 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 HLA-BQ31612 363 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 BCL7AQ4VC05 210 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 C1orf185Q5T7R7 199 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 STPG1Q5TH74 334 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 OR4F3Q6IEY1 312 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 NLRP9Q7RTR0 991 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 OR6C4Q8NGE1 309 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 OR52B6Q8NGF0 335 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SLC2A14Q8TDB8 520 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SSC4DQ8WTU2 575 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SCFD1Q8WVM8 642 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 MOCOSQ96EN8 888 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 C7orf34Q96L11 122 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 C12orf66Q96MD2 445 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 AGAP3Q96P47 875 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 PLIN2Q99541 437 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SLC6A7Q99884 636 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 FAM173AQ9BQD7 235 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 FEM1AQ9BSK4 669 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 LIME1Q9H400 295 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SGK2Q9HBY8 427 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 CRLF2Q9HC73 371 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 ESM1Q9NQ30 184 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SPHK2Q9NRA0 654 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 DEPPQ9NTK1 212 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SPATA7Q9P0W8 599 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SEC14L3Q9UDX4 400 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 ADAM28Q9UKQ2 775 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 PIGLQ9Y2B2 252 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 DOCK7Q96N67 2140 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 PNPLA6Q8IY17 1366 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SALL1Q9NSC2 1324 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 RNF212BA8MTL3 300 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 ZFAND5O76080 213 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 IGHG1P01857 330 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 IGHG3P01860 377 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 FGF4P08620 206 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 DBTP11182 482 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 MX1P20591 662 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 MMP11P24347 488 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 CSRP3P50461 194 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 PHEXP78562 749 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 FHL1Q13642 323 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 RCN1Q15293 331 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 ARMC12Q5T9G4 340 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SEL1L2Q5TEA6 688 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 ACSM5Q6NUN0 579 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 KIF6Q6ZMV9 814 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SERINC5Q86VE9 423 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 NECAB1Q8N987 351 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SUMF1Q8NBK3 374 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 STXBP6Q8NFX7 210 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 ZNF519Q8TB69 540 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 MRGPRDQ8TDS7 321 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 BADQ92934 168 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 MTMR9Q96QG7 549 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 CABLES2Q9BTV7 478 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 MCCC2Q9HCC0 563 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 SUN2Q9UH99 717 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-488P-201ENST00000515918 ZNF639Q9UID6 485 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms