RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 APCP25054 2843 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 C9JVG2 144 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD28O15084 1053 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 UTS2O95399 124 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC18A1P54219 525 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN8P56748 225 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 HBA1P69905 142 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OCRLQ01968 901 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 TP53BP2Q13625 1128 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PGS1Q32NB8 556 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 NHSL2Q5HYW2 709 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 VASNQ6EMK4 673 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PLXDC2Q6UX71 529 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 MAVSQ7Z434 540 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CAMKMTQ7Z624 323 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 NAXEQ8NCW5 288 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OR14L1PQ8NHC6 308 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMA8Q8TAA3 256 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 RND1Q92730 232 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CDS1Q92903 461 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PRDM14Q9GZV8 571 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SERHL2Q9H4I8 314 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 DKKL1Q9UK85 242 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCG2Q9UNQ0 655 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CAMK2AQ9UQM7 478 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCA12Q86UK0 2595 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA8OA6NCC3 632 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA8NF8WBI6 632 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 GMFGO60234 142 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 TOXO94900 526 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SOAT1P35610 550 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 KIR3DL1P43629 444 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 NME5P56597 212 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS26P62854 115 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SMU1Q2TAY7 513 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 AGBL2Q5U5Z8 902 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM211Q6ICI0 200 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 MARCH3Q86UD3 253 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD46Q86W74 232 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 FADS6Q8N9I5 356 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2M3Q8NG83 312 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP70Q8NHQ1 597 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5P2Q8WZ92 322 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 WDYHV1Q96HA8 205 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX37Q96LM6 180 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 C3orf14Q9HBI5 128 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ATAD3AQ9NVI7 634 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 GPATCH2Q9NW75 528 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 COQ3Q9NZJ6 369 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CSMD2Q7Z408 3487 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CSMD1Q96PZ7 3565 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CBR3O75828 277 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNK2O95069 426 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNH1O95259 989 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 LBPP18428 481 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 EPHA3P29320 983 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRNB4P30926 498 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SRD5A2P31213 254 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 GFRA1P56159 465 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PHC1P78364 1004 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR5P85299 388 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 TFF3Q07654 80 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 IFNEQ86WN2 208 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 LIX1LQ8IVB5 337 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 COX18Q8N8Q8 333 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 GATSQ8NAP1 163 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4K17Q8NGC6 315 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 MARK4Q96L34 752 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHDC3Q9BQ90 382 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 DSN1Q9H410 356 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 NEUROD4Q9HD90 331 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 THAP1Q9NVV9 213 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R10Q9NYW0 307 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 MED11Q9P086 117 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNE3Q9Y6H6 103 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 NPIPA7E9PJI5 369 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CFLARO15519 480 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 C1QCP02747 245 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ALOX5P09917 674 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 NPIPA8P0DM63 369 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 GABRA1P14867 456 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CCT3P49368 545 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms