RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.47□□□□□ -1.53
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CBX1-205ENST00000495350 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
CBX1-205ENST00000495350 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CBX1-205ENST00000495350 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5.46□□□□□ -1.54
CBX1-205ENST00000495350 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CBX1-205ENST00000495350 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CBX1-205ENST00000495350 HBMQ6B0K9 141 aa5.46□□□□□ -1.54
CBX1-205ENST00000495350 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CBX1-205ENST00000495350 C11orf71Q6IPW1 123 aa5.46□□□□□ -1.54
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