RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SLC13A2Q13183 592 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GPAT3Q53EU6 434 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LYPD8Q6UX82 237 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DTX1Q86Y01 620 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SVOPQ8N4V2 548 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PIK3R3Q92569 461 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF221Q9UK13 617 aa6.57□□□□□ -1.36
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HERC4-211ENST00000492996 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TRIM64BA6NI03 449 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DYRK3O43781 588 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 AIFM1O95831 613 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CBX5P45973 191 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 BTN3A2P78410 334 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HYAL2Q12891 473 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LTB4RQ15722 352 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ADCK1Q86TW2 530 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CDH24Q86UP0 819 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SHISA5Q8N114 240 aa6.56□□□□□ -1.36
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HERC4-211ENST00000492996 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PATE1Q8WXA2 126 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR2M4Q96R27 311 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 A0A0B4J203 849 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GABARAPO95166 117 aa6.56□□□□□ -1.36
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HERC4-211ENST00000492996 WNT1P04628 370 aa6.56□□□□□ -1.36
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HERC4-211ENST00000492996 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ACADMP11310 421 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CBLP22681 906 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HTR2BP41595 481 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RHAGQ02094 409 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ID2Q02363 134 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZFP69Q49AA0 526 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 COLEC12Q5KU26 742 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DCST1Q5T197 706 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FRMPD2BQ6IN97 320 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.56□□□□□ -1.36
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HERC4-211ENST00000492996 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.56□□□□□ -1.36
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HERC4-211ENST00000492996 LGALS12Q96DT0 336 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GIMAP5Q96F15 307 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DACH2Q96NX9 599 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF607Q96SK3 696 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TM9SF2Q99805 663 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 STARD5Q9NSY2 213 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CACNA1AO00555 2505 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GSAPA4D1B5 854 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR2A25A4D2G3 310 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CLCA1A8K7I4 914 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FAM25EA8MYX2 175 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SCO2O43819 266 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DPM1O60762 260 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NTN1O95631 604 aa6.55□□□□□ -1.36
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