RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ALG12Q9BV10 488 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ZBP1Q9H171 429 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 KLK13Q9UKR3 277 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 UFL1O94874 794 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF12O95522 483 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 OPN1LWP04000 364 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP157Q5JU67 520 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 PARGQ86W56 976 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 RAET1EQ8TD07 263 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 RLN3Q8WXF3 142 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SDSLQ96GA7 329 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 TTC25Q96NG3 672 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SOSTQ9BQB4 213 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 TIGARQ9NQ88 270 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0754O94854 1291 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 JCHAINP01591 159 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINB2P05120 415 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 HNMTP50135 292 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM17Q86X19 198 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 SENP8Q96LD8 212 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ADCY5O95622 1261 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 SPIBQ01892 262 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 BDH1Q02338 343 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CAMK4Q16566 473 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 MAPK6Q16659 721 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 REG3GQ6UW15 175 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 IFNEQ86WN2 208 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 FGFRL1Q8N441 504 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 FAM74A7A6NL05 159 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 PI15O43692 258 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 KBTBD11O94819 623 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 UGT2B4P06133 528 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGDIBP52566 201 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ARFIP1P53367 373 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CNTN2Q02246 1040 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 SELPLGQ14242 412 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CYP51A1Q16850 503 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 VASH2Q86V25 355 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 OSTF1Q92882 214 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CACNA1FO60840 1977 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 E9PAM4 449 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 K7EQM0 130 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 OR1F1O43749 312 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 IGHG3P01860 377 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 HBQ1P09105 142 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CA8P35219 290 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEA5P43359 124 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 GNPDA1P46926 289 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 HMGCS2P54868 508 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CBX1P83916 185 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 IL18R1Q13478 541 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.05□□□□□ -1.44
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