RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 RBBP8Q99708 897 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CPNE1Q99829 537 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 OR51B5Q9H339 312 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 LIME1Q9H400 295 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RASSF1Q9NS23 344 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 MS4A12Q9NXJ0 267 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PSD3Q9NYI0 1048 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 WWOXQ9NZC7 414 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ACAD8Q9UKU7 415 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ASB4Q9Y574 426 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 DNHD1Q96M86 4753 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 EFCAB8A8MWE9 144 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC188H7C350 402 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 K7EPI3 171 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PLPP1O14494 284 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TMPRSS11DO60235 418 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR75O95800 540 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 EPPINO95925 133 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GSTA2P09210 222 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC35E2BP0CK96 405 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CD99P14209 185 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 COX7A2P14406 83 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 STMN1P16949 149 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CPN2P22792 545 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SSTR1P30872 391 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TIMP3P35625 211 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GP5P40197 560 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CTXN1P60606 82 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RAB10P61026 200 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GUCY2DQ02846 1103 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FOLH1Q04609 750 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 MYBPHQ13203 477 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SLAMF1Q13291 335 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 EBPQ15125 230 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NTRK2Q16620 822 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 WLSQ5T9L3 541 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 MED27Q6P2C8 311 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR180Q86V85 440 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RNF175Q8N4F7 328 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SNX31Q8N9S9 440 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NAXEQ8NCW5 288 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 STAG3L4Q8TBR4 150 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 UBE2E3Q969T4 207 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RGMAQ96B86 450 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 DGAT2Q96PD7 388 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TIMP4Q99727 224 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SH3GL2Q99962 352 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM31Q9BZY9 425 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 UBQLN3Q9H347 655 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GALNT9Q9HCQ5 603 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CD274Q9NZQ7 290 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CNIH4Q9P003 139 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 B4GALT7Q9UBV7 327 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 COPS7AQ9UBW8 275 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SNX24Q9Y343 169 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SAR1BQ9Y6B6 198 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 HCFC1P51610 2035 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A0A6YYD5 115 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC189A1A4V9 331 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 OR6C76A6NM76 312 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 A6NNC1 897 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 HSPB2A8KAH6 182 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ALG1L2C9J202 215 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 H0YIV9 168 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SAP18O00422 153 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 UGDHO60701 494 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 KERAO60938 352 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SH3BGRLO75368 114 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 EEDO75530 441 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM155BO75949 473 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ZWINTO95229 277 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 HPNP05981 417 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC35E2P0CK97 266 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 S1PR1P21453 382 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SERPINB3P29508 390 aa5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms