RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487270.5

RAD51B-210, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 2,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-210ENST00000487270 CHFRQ96EP1 664 aa6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SLC35A4Q96G79 324 aa6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 FRMD6Q96NE9 622 aa6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 TBX5Q99593 518 aa6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 TEX101Q9BY14 249 aa6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.21□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SHISA3A0PJX4 238 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 HMX3A6NHT5 357 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SOCS6O14544 535 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 CDC42EP2O14613 210 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SLC31A1O15431 190 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 PROM1O43490 865 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 KAT7O95251 611 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 THY1P04216 161 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 FUT1P19526 365 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 PKLRP30613 574 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 AHRP35869 848 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 ASAH1Q13510 395 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 GPR68Q15743 365 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 NDUFA5Q16718 116 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 CCNJQ5T5M9 372 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 TRIQKQ629K1 86 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 PLET1Q6UQ28 207 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 MTSS1LQ765P7 747 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 RTL10Q7L3V2 364 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 AP3S1Q92572 193 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 BADQ92934 168 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SAMD8Q96LT4 415 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 MFRPQ9BY79 579 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 RNF121Q9H920 327 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 MED20Q9H944 212 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 COL4A3Q01955 1670 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 KNL1Q8NG31 2342 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 IRGMA1A4Y4 181 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 LINC01553A4QN01 128 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 FAM25AB3EWG3 89 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 FAM25CB3EWG5 89 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 FAM25GB3EWG6 89 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 GABRPO00591 440 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SURF4O15260 269 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 CEACAM5P06731 702 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 GJA4P35212 333 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 DDOSTP39656 456 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SEC13P55735 322 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 ID2Q02363 134 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 DSG2Q14126 1118 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 QPRTQ15274 297 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 OR7G2Q8NG99 324 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SFXN5Q8TD22 340 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SLC7A6Q92536 515 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 OSTF1Q92882 214 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 CDS1Q92903 461 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 RFKQ969G6 155 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF681Q96N22 645 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SNX18Q96RF0 628 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 TEX12Q9BXU0 123 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 CERS4Q9HA82 394 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 NLKQ9UBE8 527 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.2□□□□□ -1.42
RAD51B-210ENST00000487270 LIPT1Q9Y234 373 aa6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms