RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484918.1

MRPL23-209, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 5

Gene MRPL23, Length 232 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-209	ENST00000484918	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	FADS6	Q8N9I5	356 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	DPF1	Q92782	380 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	FOPNL	Q96NB1	174 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	FAT1	Q14517	4588 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918		A0A0G2JN53	185 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918		F8VZ95	297 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	CLGN	O14967	610 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	ADAMDEC1	O15204	470 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	OR1F1	O43749	312 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	UGT2B11	O75310	529 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	NIPSNAP2	O75323	286 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	FBXO24	O75426	580 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	FOXH1	O75593	365 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	SYNGR4	O95473	234 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	CRTAM	O95727	393 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	GUCA1C	O95843	209 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	IGHM	P01871	453 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	GSN	P06396	782 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	CDH1	P12830	882 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	COX7A2	P14406	83 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	PFKFB1	P16118	471 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	NAGA	P17050	411 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	HK1	P19367	917 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	IMPA1	P29218	277 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	GABRA5	P31644	462 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	IER3	P46695	156 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	LIM2	P55344	173 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	BTN3A2	P78410	334 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	DGCR2	P98153	550 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	MPP3	Q13368	585 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	GABRA6	Q16445	453 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	RANBP10	Q6VN20	620 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	SPATA21	Q7Z572	469 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	RNF138	Q8WVD3	245 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	MUS81	Q96NY9	551 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	FCRL5	Q96RD9	977 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	PRR25	Q96S07	402 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	ZMAT4	Q9H898	229 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	DAPP1	Q9UN19	280 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	TRBC2	A0A5B9	178 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	URAD	A6NGE7	173 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918		F8W8V4	182 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	GNA14	O95837	355 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	CBX7	O95931	251 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	YES1	P07947	543 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	NPR2	P20594	1047 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	GRK2	P25098	689 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	PSMA3	P25788	255 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	ADRA1A	P35348	466 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	THBS4	P35443	961 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	GATA4	P43694	442 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	SCTR	P47872	440 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	NRG3	P56975	720 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	TBPL1	P62380	186 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	ATL3	Q6DD88	541 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MRPL23-209	ENST00000484918	C11orf88	Q6PI97	169 aa		5.25	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms