RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRKXP51817 358 aa15.64■□□□□ 0.09
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGEA12P43365 314 aa15.63■□□□□ 0.09
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HYAL4Q2M3T9 481 aa15.63■□□□□ 0.09
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SDR9C7Q8NEX9 313 aa15.63■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR78Q96P69 363 aa15.63■□□□□ 0.09
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JMJD7P0C870 316 aa15.62■□□□□ 0.09
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OLIG3Q7RTU3 272 aa15.62■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM239Q8WW34 195 aa15.62■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LMF1Q96S06 567 aa15.62■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.62■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM227AF5H4B4 570 aa15.62■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.099e-7■■■■□ 22.6
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CWH43Q9H720 699 aa15.62■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
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