RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 GPX2P18283 190 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 NPR2P20594 1047 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 FDXRP22570 491 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 HTR2AP28223 471 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ACADLP28330 430 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 AGTR1P30556 359 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 KDELR2P33947 212 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 STAT5AP42229 794 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SLC1A2P43004 574 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 RGS4P49798 205 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 RBP2P50120 134 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MMP15P51511 669 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 STAT5BP51692 787 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MTPNP58546 118 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 RAB2AP61019 212 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 BDH1Q02338 343 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 DSC2Q02487 901 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 IL10RBQ08334 325 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SSPNQ14714 243 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PPA1Q15181 289 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 LY6KQ17RY6 165 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 BSPRYQ5W0U4 402 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 VASNQ6EMK4 673 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TRNP1Q6NT89 227 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CES3Q6UWW8 571 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 METTL7BQ6UX53 244 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ABHD13Q7L211 337 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 COMTD1Q86VU5 262 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TPRA1Q86W33 373 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CPXM2Q8N436 756 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 NR4A3Q92570 626 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 NT5C3BQ969T7 300 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MALSU1Q96EH3 234 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PHF21BQ96EK2 531 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 Q96M66 194 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 NELL2Q99435 816 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PFDN5Q99471 154 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 LGMNQ99538 433 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SEC11CQ9BY50 192 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MTG2Q9H4K7 406 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CLMPQ9H6B4 373 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 THSD1Q9NS62 852 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 RASL12Q9NYN1 266 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 V9GYQ6 96 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 PATJQ8NI35 1801 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PRB8 838 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 OR2M5A3KFT3 312 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 MYADML2A6NDP7 307 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 ZNF879B4DU55 563 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 CLIC1O00299 241 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 WWP2O00308 870 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-211ENST00000481115 IRAK2O43187 625 aa6.72□□□□□ -1.33
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